159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2227 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  71.79 
 
 
429 aa  659  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  71.79 
 
 
429 aa  668  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  71.1 
 
 
429 aa  661  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  71.33 
 
 
429 aa  662  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  72.73 
 
 
429 aa  669  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  72.81 
 
 
424 aa  662  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  72.49 
 
 
429 aa  665  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  73.19 
 
 
429 aa  669  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  72.73 
 
 
429 aa  667  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  70.07 
 
 
431 aa  643  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
429 aa  887  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  70.52 
 
 
429 aa  634  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  74.23 
 
 
433 aa  671  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  71.33 
 
 
429 aa  659  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  76.69 
 
 
454 aa  700  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  66.98 
 
 
439 aa  599  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  54.94 
 
 
431 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  46.78 
 
 
419 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  46.14 
 
 
430 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  45.2 
 
 
463 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  45.56 
 
 
439 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.30652e-13 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  43.87 
 
 
428 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  43.97 
 
 
412 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  43.36 
 
 
423 aa  357  2e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  41.94 
 
 
421 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  40.9 
 
 
453 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  43.91 
 
 
426 aa  337  3e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  39.44 
 
 
432 aa  320  4e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  41.9 
 
 
441 aa  315  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  40.27 
 
 
424 aa  310  3e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  40.36 
 
 
443 aa  309  7e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
488 aa  290  4e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  39.48 
 
 
420 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  38.32 
 
 
439 aa  287  3e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  36.99 
 
 
510 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  37.44 
 
 
460 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  37.8 
 
 
443 aa  263  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.358137 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  36.93 
 
 
447 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  32.49 
 
 
478 aa  232  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  30.95 
 
 
692 aa  202  1e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 
480 aa  67.8  3e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  30.43 
 
 
308 aa  57.8  3e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3085  proline iminopeptidase  28.95 
 
 
345 aa  57.4  5e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  30.82 
 
 
335 aa  57  7e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  30.3 
 
 
313 aa  55.8  1e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  30.46 
 
 
323 aa  54.7  3e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  24.85 
 
 
535 aa  53.5  7e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  24.85 
 
 
535 aa  53.5  7e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  32.82 
 
 
321 aa  52.4  1e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  29.73 
 
 
330 aa  52.8  1e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  29.94 
 
 
312 aa  51.6  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  30.77 
 
 
323 aa  52  2e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2466  prolyl aminopeptidase  36.96 
 
 
346 aa  51.6  3e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186961 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
291 aa  51.2  3e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  24.62 
 
 
508 aa  50.8  4e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  25.18 
 
 
301 aa  50.8  4e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  29.45 
 
 
319 aa  50.4  5e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.89953e-08  hitchhiker  3.38054e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  30.3 
 
 
323 aa  50.8  5e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  31.58 
 
 
306 aa  50.8  5e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  24.74 
 
 
291 aa  50.1  8e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.68473e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  28.97 
 
 
323 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  24.82 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  24.55 
 
 
546 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  28.14 
 
 
320 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  22.37 
 
 
527 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  29.37 
 
 
316 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  24.37 
 
 
494 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  32.31 
 
 
311 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  27.27 
 
 
321 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1352  proline iminopeptidase  28.97 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.800954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  24.06 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 
539 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0317  prolyl aminopeptidase  28.12 
 
 
318 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.463031  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  27.46 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  28.88 
 
 
317 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  24.09 
 
 
291 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  29.06 
 
 
313 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
291 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4358  proline iminopeptidase  30.77 
 
 
361 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  27.88 
 
 
323 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0316  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
317 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0772  alpha/beta fold family hydrolase  25.36 
 
 
271 aa  47  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  22.35 
 
 
517 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  27.78 
 
 
315 aa  47  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  27.71 
 
 
323 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  23.36 
 
 
476 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  35.11 
 
 
322 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0320  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
317 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  23.64 
 
 
546 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0312  prolyl aminopeptidase  28.88 
 
 
301 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.361295  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4400  proline iminopeptidase, putative  32.79 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0733  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 
365 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.0620528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  27.88 
 
 
323 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  32.8 
 
 
320 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  26.32 
 
 
540 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  26.57 
 
 
521 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1737  proline iminopeptidase  28.9 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.146462  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2006  proline iminopeptidase  30.63 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.749517  hitchhiker  0.00407135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
675 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>