123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2160 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  89.39 
 
 		 264 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  89.39 
 
 		 264 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  89.39 
 
 		 264 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  88.26 
 
 		 264 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  88.64 
 
 		 264 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  88.64 
 
 		 264 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  88.64 
 
 		 264 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  88.64 
 
 		 264 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  88.26 
 
 		 264 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  86.59 
 
 		 262 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  83.27 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  67.69 
 
 		 262 aa  377  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  59.62 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  60.7 
 
 		 259 aa  328  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  66.39 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  62.16 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  70.13 
 
 		 248 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  59.84 
 
 		 267 aa  309  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  69.7 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  58.78 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  60.77 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  63.01 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  58.63 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  64.41 
 
 		 242 aa  298  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  63.45 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  53.17 
 
 		 261 aa  294  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  55.09 
 
 		 338 aa  295  8e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  54.66 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  57.89 
 
 		 270 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  54.96 
 
 		 327 aa  287  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  56.2 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  57.25 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  57.2 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  57.44 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  56.18 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  54.17 
 
 		 277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  57.02 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  56.57 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  56.57 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  56.57 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  56.18 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  55.78 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  55.78 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  55.78 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  54.3 
 
 		 259 aa  262  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  57.53 
 
 		 265 aa  262  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  57.14 
 
 		 265 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  54.05 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  56.15 
 
 		 262 aa  238  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  54.47 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  55.5 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  55.5 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  52.1 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  46.29 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  40 
 
 		 225 aa  179  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  42.55 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  40.6 
 
 		 316 aa  178  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  39.48 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  40.79 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  39.15 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  41.63 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  40.77 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  41.2 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  39.83 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  38.67 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  33.62 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  33.19 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45622  predicted protein  34.05 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.885288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  33.62 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  30.25 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  32.59 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  30.59 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  30.08 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  30.08 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  30.08 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  31.33 
 
 		 224 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39292  predicted protein  29.36 
 
 		 243 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  35.08 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  35.29 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  29.32 
 
 		 246 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  32.46 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  31.33 
 
 		 224 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  35.07 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  32.92 
 
 		 225 aa  92.8  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  31.22 
 
 		 222 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  32.21 
 
 		 349 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  31.88 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  30.8 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  30.38 
 
 		 222 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  32.85 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45624  predicted protein  28 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  30.99 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  30.34 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  30.53 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  29.31 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  28.44 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>