49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2142 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  248  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  81.97 
 
 		 135 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  80.51 
 
 		 119 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  80.51 
 
 		 119 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  79.66 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  79.66 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  77.97 
 
 		 119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  77.97 
 
 		 119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  77.12 
 
 		 119 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2676  hypothetical protein  75.63 
 
 		 119 aa  194  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208691  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  77.12 
 
 		 119 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  76.27 
 
 		 119 aa  193  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1903  hypothetical protein  73.11 
 
 		 119 aa  183  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000176347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  68.6 
 
 		 124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1946  hypothetical protein  68.91 
 
 		 119 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000181986  normal  0.0225511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  66.39 
 
 		 119 aa  177  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1415  hypothetical protein  47.01 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.130351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2718  hypothetical protein  48.76 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.145637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  43.22 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  45.19 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  40.87 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  45.19 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  40.74 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  40.59 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  36.54 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  36.54 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  36.54 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  36.54 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0859  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  35.58 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  36.46 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  38.55 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  34.62 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  34.62 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  32.69 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  30.28 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  32.69 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00395  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3876  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  32.53 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  31.07 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  36.63 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  31.33 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  31.17 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1354  hypothetical protein  27.68 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  36.62 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>