More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2133 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2362  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.96 
 
 
356 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000229628  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2477  alcohol dehydrogenase, iron-containing  85.39 
 
 
356 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2374  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.67 
 
 
356 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000461423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1985  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.39 
 
 
356 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000240423  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2423  iron-containing alcohol dehydrogenase  89.89 
 
 
356 aa  670    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.195896  decreased coverage  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  91.57 
 
 
356 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000304818  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2133  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
356 aa  744    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000021113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2183  iron-containing alcohol dehydrogenase  90.45 
 
 
356 aa  683    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000901085  normal  0.0100031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2477  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.39 
 
 
356 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  decreased coverage  0.000108776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1852  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.83 
 
 
356 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318302  hitchhiker  0.00000012761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2126  iron-containing alcohol dehydrogenase  84.55 
 
 
356 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  unclonable  0.0000187018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  95.79 
 
 
356 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0108166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1907  iron-containing alcohol dehydrogenase  85.11 
 
 
356 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000681421  unclonable  0.0000000000909138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1640  alcohol dehydrogenase, iron-containing  82.87 
 
 
356 aa  631  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000263255  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2140  Iron-containing alcohol dehydrogenase  69.19 
 
 
357 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.741299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3202  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.84 
 
 
353 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10583  ethanolamine utilization protein-like protein  53.09 
 
 
614 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0804  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.87 
 
 
358 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2803  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.06 
 
 
365 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1890  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 
358 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 
357 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2213  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.94 
 
 
359 aa  299  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
384 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.3 
 
 
387 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
388 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
388 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
388 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
388 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
384 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
389 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
382 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
382 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.8 
 
 
398 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 
384 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
374 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.71 
 
 
385 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
383 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
388 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  30.73 
 
 
388 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  30.11 
 
 
382 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 
368 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 
380 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.26 
 
 
395 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  26.87 
 
 
395 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.87 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  28.09 
 
 
399 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  26.53 
 
 
395 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2222  propanol dehydrogenase  26.69 
 
 
370 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.806517 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 
385 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.75 
 
 
376 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2275  propanol dehydrogenase  26.69 
 
 
370 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0229422 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  26.53 
 
 
395 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  26.53 
 
 
395 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  26.53 
 
 
395 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.67 
 
 
382 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 
395 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.51 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.33 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.88 
 
 
385 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.51 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  26.53 
 
 
369 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2388  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  27.46 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  28.57 
 
 
382 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2175  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  27.46 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.85 
 
 
380 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  26.53 
 
 
395 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  24.15 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.57 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
397 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.81 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.81 
 
 
368 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
395 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
387 aa  96.3  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
382 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  26.96 
 
 
383 aa  96.3  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.89 
 
 
381 aa  96.3  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1164  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 
379 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144236  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  29.05 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 
382 aa  95.9  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2229  propanediol utilization: propanol dehydrogenase  27.46 
 
 
370 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.14 
 
 
400 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
400 aa  95.9  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0905  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  29.37 
 
 
382 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1823  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  29.37 
 
 
382 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1668  NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.37 
 
 
382 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0717  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  29.37 
 
 
382 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  26.99 
 
 
385 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1646  putative NAD-dependent 4-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.37 
 
 
382 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627044  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  26.99 
 
 
385 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.14 
 
 
400 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1435  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  29.37 
 
 
382 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>