More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2115 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00216  acyl-CoA dehydrogenase  52.76 
 
 		 814 aa  803    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3386  Protein of unknown function DUF1974  52.76 
 
 		 814 aa  804    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1893  acyl-CoA dehydrogenase  48.62 
 
 		 815 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141749 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1490  acyl-CoA dehydrogenase  46.89 
 
 		 715 aa  666    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0249  acyl-CoA dehydrogenase  52.76 
 
 		 814 aa  804    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2051  acyl-CoA dehydrogenase  78.23 
 
 		 758 aa  1243    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.217248  normal  0.456304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0537  acyl-CoA dehydrogenase  50.6 
 
 		 835 aa  747    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0153828  normal  0.335632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2067  acyl-CoA dehydrogenase  79.17 
 
 		 758 aa  1244    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0937287  decreased coverage  0.0000695411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1999  acyl-CoA dehydrogenase  49.93 
 
 		 815 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0412808  decreased coverage  0.0000000639104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3171  acyl-CoA dehydrogenase  52.5 
 
 		 815 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2265  acyl-CoA dehydrogenase  50.59 
 
 		 809 aa  770    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.105955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0265  acyl-CoA dehydrogenase  52.5 
 
 		 814 aa  803    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.717357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1676  acyl-CoA dehydrogenase  48.82 
 
 		 832 aa  755    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761188  normal  0.240314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1870  acyl-CoA dehydrogenase  50.93 
 
 		 815 aa  761    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3822  acyl-CoA dehydrogenase  49.01 
 
 		 815 aa  729    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2492  acyl-CoA dehydrogenase  82.26 
 
 		 759 aa  1286    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2536  acyl-CoA dehydrogenase  50.98 
 
 		 815 aa  778    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3857  acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.62 
 
 		 815 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.870588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2127  acyl-CoA dehydrogenase  82.53 
 
 		 759 aa  1292    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00720758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15490  acyl-CoA dehydrogenase  48.45 
 
 		 815 aa  683    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1691  acyl-CoA dehydrogenase  48.34 
 
 		 828 aa  726    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0432  acyl-CoA dehydrogenase  50.59 
 
 		 836 aa  762    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1690  acyl-CoA dehydrogenase  48.21 
 
 		 828 aa  725    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1468  acyl-CoA dehydrogenase  49.54 
 
 		 815 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.890646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1628  acyl-CoA dehydrogenase  49.54 
 
 		 815 aa  762    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1815  acyl-CoA dehydrogenase  78.39 
 
 		 759 aa  1251    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0595406  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2172  acyl-CoA dehydrogenase  82.53 
 
 		 759 aa  1292    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.272343  normal  0.175191 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1835  acyl-CoA dehydrogenase  46.35 
 
 		 994 aa  688    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2338  acyl-CoA dehydrogenase  78.49 
 
 		 760 aa  1222    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.797755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1544  acyl-CoA dehydrogenase  50.72 
 
 		 784 aa  790    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0853542 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2108  acyl-CoA dehydrogenase  52.05 
 
 		 815 aa  781    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000635776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2342  acyl-CoA dehydrogenase  50.46 
 
 		 815 aa  759    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3399  acyl-CoA dehydrogenase  52.76 
 
 		 814 aa  804    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2542  acyl-CoA dehydrogenase  79.02 
 
 		 758 aa  1251    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.204346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2995  acyl-CoA dehydrogenase  47.15 
 
 		 755 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0417  acyl-CoA dehydrogenase  50.72 
 
 		 836 aa  763    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332729  hitchhiker  0.000590412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2257  acyl-CoA dehydrogenase  82.12 
 
 		 759 aa  1284    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00094782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1735  acyl-CoA dehydrogenase  49.26 
 
 		 781 aa  748    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.445191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1823  acyl-CoA dehydrogenase  51.52 
 
 		 814 aa  781    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1260  acyl-CoA dehydrogenase  45.97 
 
 		 858 aa  684    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.276244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4184  acyl-CoA dehydrogenase  50.07 
 
 		 815 aa  741    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0233  acyl-CoA dehydrogenase  52.76 
 
 		 814 aa  805    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02152  acyl-CoA dehydrogenase  50.4 
 
 		 820 aa  795    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0358  acyl-CoA dehydrogenase  52.76 
 
 		 814 aa  799    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.7933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0949  acyl-CoA dehydrogenase  52.96 
 
 		 818 aa  801    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0094  acyl-CoA dehydrogenase  50.2 
 
 		 779 aa  749    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0805  acyl-CoA dehydrogenase  50.33 
 
 		 829 aa  737    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0758  acyl-CoA dehydrogenase  53.09 
 
 		 814 aa  793    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2019  acyl-CoA dehydrogenase  50.85 
 
 		 815 aa  776    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000019403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0923  acyl-CoA dehydrogenase  50.75 
 
 		 812 aa  753    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02638  acyl-CoA dehydrogenase  62.14 
 
 		 761 aa  954    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2774  acyl-CoA dehydrogenase  49.21 
 
 		 832 aa  760    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0195981  normal  0.587506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1503  acyl-CoA dehydrogenase  49.54 
 
 		 815 aa  730    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.943527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0253  acyl-CoA dehydrogenase  52.76 
 
 		 814 aa  804    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2395  acyl-CoA dehydrogenase  49.54 
 
 		 815 aa  766    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1917  acyl-CoA dehydrogenase  51.32 
 
 		 815 aa  757    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00575597  normal  0.572589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1764  acyl-CoA dehydrogenase  51.13 
 
 		 815 aa  781    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2115  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 758 aa  1571    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000818712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1510  acyl-CoA dehydrogenase  44.4 
 
 		 815 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1085  acyl-CoA dehydrogenase  46.34 
 
 		 756 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3309  acyl-CoA dehydrogenase  52.15 
 
 		 815 aa  787    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2120  acyl-CoA dehydrogenase  46.35 
 
 		 979 aa  688    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3003  acyl-CoA dehydrogenase  49.66 
 
 		 744 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00231993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3614  acyl-CoA dehydrogenase  45.64 
 
 		 815 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0152868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1504  acyl-CoA dehydrogenase  49.38 
 
 		 745 aa  701    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135782  normal  0.786071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1791  acyl-CoA dehydrogenase  50.99 
 
 		 815 aa  779    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000904865  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0174  acyl-CoA dehydrogenase  47.96 
 
 		 756 aa  664    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92795 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0687  acyl-CoA dehydrogenase  46.46 
 
 		 715 aa  661    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2393  acyl-CoA dehydrogenase  51.05 
 
 		 815 aa  777    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2604  acyl-CoA dehydrogenase  50.99 
 
 		 815 aa  770    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.114401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02616  acyl-CoA dehydrogenase  51.23 
 
 		 749 aa  718    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03204  acyl-CoA dehydrogenase  51.46 
 
 		 814 aa  784    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1688  acyl-CoA dehydrogenase  51.03 
 
 		 751 aa  706    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2492  acyl-CoA dehydrogenase  48.35 
 
 		 821 aa  757    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000835865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1234  acyl-CoA dehydrogenase  49.93 
 
 		 745 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3810  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.55 
 
 		 833 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.753342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2306  acyl-CoA dehydrogenase  50.98 
 
 		 815 aa  776    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000182172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2244  acyl-CoA dehydrogenase  82.53 
 
 		 759 aa  1292    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2049  acyl-CoA dehydrogenase  82.26 
 
 		 759 aa  1286    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156017  normal  0.197509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2146  acyl-CoA dehydrogenase  50.98 
 
 		 815 aa  778    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000466188  normal  0.548318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1926  acyl-CoA dehydrogenase  82.39 
 
 		 759 aa  1290    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.442387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2223  acyl-CoA dehydrogenase  51.11 
 
 		 815 aa  779    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00555832  normal  0.222627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2124  acyl-CoA dehydrogenase  53.91 
 
 		 824 aa  818    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441583 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2128  acyl-CoA dehydrogenase  46.01 
 
 		 774 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0257482  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1869  acyl-CoA dehydrogenase  51.31 
 
 		 815 aa  782    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.203796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1889  acyl-CoA dehydrogenase  85.48 
 
 		 758 aa  1336    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01663  acyl-CoA dehydrogenase  48.18 
 
 		 803 aa  684    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0967153  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2067  acyl-CoA dehydrogenase  50.85 
 
 		 815 aa  776    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000576989  hitchhiker  0.00617019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27730  acyl-CoA dehydrogenase  49.87 
 
 		 815 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0291961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1700  acyl-CoA dehydrogenase  49.73 
 
 		 889 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1340  acyl-CoA dehydrogenase  61.33 
 
 		 760 aa  939    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.920071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1863  acyl-CoA dehydrogenase  82.66 
 
 		 759 aa  1296    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0490  acyl-CoA dehydrogenase  46.54 
 
 		 949 aa  696    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3064  acyl-CoA dehydrogenase  48.52 
 
 		 825 aa  686    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221782  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3558  acyl-CoA dehydrogenase  46.36 
 
 		 778 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2154  acyl-CoA dehydrogenase  82.39 
 
 		 759 aa  1288    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.136842  normal  0.840722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2323  acyl-CoA dehydrogenase  51.11 
 
 		 815 aa  779    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.626171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0217  acyl-CoA dehydrogenase  52.76 
 
 		 814 aa  803    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2319  acyl-CoA dehydrogenase  50.98 
 
 		 815 aa  776    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000853883  hitchhiker  0.00160495 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4530  acyl-CoA dehydrogenase  82.53 
 
 		 759 aa  1292    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>