More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2075 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  89.17 
 
 
554 aa  1045    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  69.37 
 
 
554 aa  822    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  69.37 
 
 
554 aa  822    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  69.73 
 
 
554 aa  824    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  67.57 
 
 
554 aa  800    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  69.19 
 
 
554 aa  816    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  68.77 
 
 
554 aa  813    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  88.09 
 
 
554 aa  1025    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  69.01 
 
 
554 aa  819    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  69.73 
 
 
554 aa  825    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  69.37 
 
 
554 aa  822    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  70.04 
 
 
554 aa  843    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  85.92 
 
 
554 aa  1007    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  69.19 
 
 
554 aa  818    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  62.9 
 
 
563 aa  716    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  67.39 
 
 
554 aa  799    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  61.14 
 
 
563 aa  675    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  69.86 
 
 
554 aa  835    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  88.99 
 
 
554 aa  1041    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  62.72 
 
 
563 aa  714    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  64.14 
 
 
562 aa  759    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  68.65 
 
 
554 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  85.46 
 
 
557 aa  999    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  68.05 
 
 
555 aa  822    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  68.47 
 
 
554 aa  816    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  68.83 
 
 
554 aa  811    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  68.95 
 
 
554 aa  823    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  100 
 
 
555 aa  1158    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  69.01 
 
 
554 aa  814    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  68.65 
 
 
554 aa  817    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  86.1 
 
 
553 aa  998    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  67.57 
 
 
554 aa  800    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  66.85 
 
 
556 aa  808    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  69.37 
 
 
554 aa  822    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  61.14 
 
 
564 aa  703    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  88.45 
 
 
554 aa  1029    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  88.45 
 
 
554 aa  1031    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  86.28 
 
 
554 aa  1016    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  68.83 
 
 
554 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  68.83 
 
 
554 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  69.37 
 
 
554 aa  822    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  88.45 
 
 
554 aa  1029    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  86.28 
 
 
552 aa  1003    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  85.02 
 
 
554 aa  996    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  88.99 
 
 
554 aa  1041    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  69.37 
 
 
556 aa  810    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  69.37 
 
 
554 aa  822    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  66.12 
 
 
556 aa  795    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  88.81 
 
 
554 aa  1039    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  64.86 
 
 
558 aa  763    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  68.83 
 
 
554 aa  818    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  69.01 
 
 
554 aa  800    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  88.99 
 
 
554 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  51.71 
 
 
596 aa  596  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  50.75 
 
 
592 aa  569  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  48.71 
 
 
571 aa  545  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  52.29 
 
 
573 aa  541  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  46.26 
 
 
638 aa  500  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  45.13 
 
 
537 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  41.49 
 
 
543 aa  375  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.24 
 
 
528 aa  334  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  37.28 
 
 
503 aa  331  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  40.45 
 
 
530 aa  309  8e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  36.51 
 
 
498 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  36.11 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  37.17 
 
 
537 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.52 
 
 
512 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.01 
 
 
510 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.01 
 
 
510 aa  229  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.01 
 
 
510 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.01 
 
 
510 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.01 
 
 
510 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.01 
 
 
510 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.01 
 
 
510 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  31.34 
 
 
492 aa  223  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000126945  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  31.6 
 
 
482 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  31.25 
 
 
484 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 
660 aa  203  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.85 
 
 
624 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.31 
 
 
536 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0140  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.04 
 
 
614 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0103295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.56 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.08 
 
 
660 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.25 
 
 
666 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1299  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.64 
 
 
613 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294849  normal  0.177591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.33 
 
 
678 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29.01 
 
 
606 aa  195  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  29.47 
 
 
599 aa  194  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5684  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.04 
 
 
607 aa  193  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.195642  hitchhiker  0.00587567 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.59 
 
 
626 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.02 
 
 
613 aa  191  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.53 
 
 
633 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.34 
 
 
619 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.47 
 
 
601 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2864  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.43 
 
 
678 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.113141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.93 
 
 
590 aa  186  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.27 
 
 
633 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1627  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.76 
 
 
615 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.27 
 
 
633 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.27 
 
 
633 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>