More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2031 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  54.74 
 
 		 774 aa  744    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 641 aa  1330    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  60.19 
 
 		 631 aa  798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  55.45 
 
 		 665 aa  728    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  55.74 
 
 		 665 aa  741    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  63.26 
 
 		 639 aa  823    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  55.17 
 
 		 786 aa  739    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  55.67 
 
 		 778 aa  743    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  56.04 
 
 		 686 aa  740    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  52.18 
 
 		 683 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  57.06 
 
 		 654 aa  755    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  55.87 
 
 		 765 aa  745    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  44.98 
 
 		 644 aa  551  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  40.79 
 
 		 609 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  39.4 
 
 		 620 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  38.47 
 
 		 623 aa  468  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  38.7 
 
 		 619 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  36.62 
 
 		 630 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  32.44 
 
 		 610 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.45 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.99 
 
 		 510 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  31.23 
 
 		 1021 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.83 
 
 		 583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  27.93 
 
 		 589 aa  138  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 528 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 		 528 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  27.11 
 
 		 593 aa  136  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  25.35 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.51 
 
 		 588 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  24.83 
 
 		 574 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  23.75 
 
 		 600 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.36 
 
 		 620 aa  130  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  28.83 
 
 		 838 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  27.31 
 
 		 587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  26.92 
 
 		 588 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 		 575 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.39 
 
 		 599 aa  128  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26 
 
 		 836 aa  128  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.15 
 
 		 481 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  24.43 
 
 		 545 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 		 583 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.97 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.72 
 
 		 524 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.88 
 
 		 484 aa  125  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.72 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.3 
 
 		 515 aa  124  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 541 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  24.86 
 
 		 642 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  24.24 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  26.08 
 
 		 562 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  27.14 
 
 		 814 aa  122  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  24.94 
 
 		 614 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 593 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  29.02 
 
 		 622 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  24.9 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  27.16 
 
 		 703 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 649 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  23.51 
 
 		 584 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  25.54 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  25.64 
 
 		 586 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 		 595 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  25.9 
 
 		 574 aa  117  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.37 
 
 		 589 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  26.85 
 
 		 493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  25.64 
 
 		 586 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  26.1 
 
 		 610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  25.89 
 
 		 739 aa  115  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  28.06 
 
 		 575 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  25.93 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.63 
 
 		 462 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.82 
 
 		 610 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  25.3 
 
 		 1145 aa  113  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  24.46 
 
 		 586 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  24.8 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.53 
 
 		 2638 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  25.2 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  24.22 
 
 		 509 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.36 
 
 		 582 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  31.1 
 
 		 258 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  24.11 
 
 		 481 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27 
 
 		 2068 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  27.07 
 
 		 715 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  25.2 
 
 		 586 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  43.75 
 
 		 609 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  25.58 
 
 		 488 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  27.5 
 
 		 571 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  25 
 
 		 586 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  25 
 
 		 586 aa  107  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  24.8 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  24.8 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  24.8 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  24.84 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  26.53 
 
 		 608 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  24.67 
 
 		 752 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  24.61 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  26.72 
 
 		 578 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3195  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  21.06 
 
 		 1193 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.36 
 
 		 481 aa  103  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>