199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2027 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 415 aa  819    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  79.9 
 
 		 423 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  81.36 
 
 		 424 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  82.21 
 
 		 423 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  81.97 
 
 		 423 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  84.1 
 
 		 421 aa  682    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  81.25 
 
 		 423 aa  658    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  79.9 
 
 		 423 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  79.9 
 
 		 423 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  82.47 
 
 		 421 aa  641    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  79.66 
 
 		 423 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  79.9 
 
 		 423 aa  664    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  76.31 
 
 		 415 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  73.81 
 
 		 415 aa  591  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  66.91 
 
 		 431 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  66.91 
 
 		 431 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  69.21 
 
 		 407 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  66.91 
 
 		 431 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  64.81 
 
 		 435 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  61.76 
 
 		 436 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  65.38 
 
 		 428 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  63.13 
 
 		 424 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  63.88 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  63.83 
 
 		 435 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  60.88 
 
 		 410 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  56.59 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  59.39 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  54.5 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  55.15 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  51.56 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  53.19 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  53.5 
 
 		 403 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  55.78 
 
 		 413 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  55.78 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  53.76 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  51.18 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  50.74 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  50 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  46.45 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  46.17 
 
 		 471 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  43.11 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  48.24 
 
 		 428 aa  342  8e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  48.79 
 
 		 429 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  44.17 
 
 		 413 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  47.2 
 
 		 405 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  44.2 
 
 		 412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  40.96 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  48.33 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  39.86 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  46.92 
 
 		 408 aa  295  8e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  42.24 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  46.67 
 
 		 408 aa  293  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  38.7 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  39.66 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  37.92 
 
 		 417 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  39 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  36.57 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  47.17 
 
 		 485 aa  262  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  34.95 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  37.03 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  34.32 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  36.05 
 
 		 414 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  33.64 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  33.82 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  35.4 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  35.4 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  35.4 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  35.4 
 
 		 438 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  33.58 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  33.58 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  35.15 
 
 		 438 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  35.15 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  35.59 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  35.59 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  35.59 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  35.59 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  35.34 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  35.42 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  32.08 
 
 		 412 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  37.2 
 
 		 421 aa  229  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  34.26 
 
 		 425 aa  225  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  33.17 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  35.06 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  32.45 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  34.15 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  33.33 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  35.63 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  33.9 
 
 		 418 aa  216  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  33.33 
 
 		 434 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  34.84 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  34.61 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  32.6 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  28.96 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  32.49 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 488 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  31.48 
 
 		 440 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  30.69 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1420  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  30.33 
 
 		 444 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>