135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2024 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2024  AsmA  100 
 
 		 614 aa  1219    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  48.46 
 
 		 606 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  47.57 
 
 		 607 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  47.74 
 
 		 607 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  47.57 
 
 		 606 aa  554  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  47.57 
 
 		 607 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  45.32 
 
 		 614 aa  542  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  47.24 
 
 		 607 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  47.42 
 
 		 606 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  47.42 
 
 		 606 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  47.92 
 
 		 606 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  44.48 
 
 		 606 aa  522  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  46.01 
 
 		 608 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  44.9 
 
 		 612 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  42.67 
 
 		 611 aa  498  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  44.07 
 
 		 604 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  32 
 
 		 695 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  32.24 
 
 		 695 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  31.55 
 
 		 640 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  31.91 
 
 		 703 aa  276  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  34.85 
 
 		 719 aa  213  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25.23 
 
 		 696 aa  190  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  24.47 
 
 		 709 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  29.62 
 
 		 712 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  34.56 
 
 		 893 aa  157  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  33.76 
 
 		 699 aa  153  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  28.95 
 
 		 742 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  28.12 
 
 		 812 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  29.55 
 
 		 797 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  25.15 
 
 		 682 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  23.81 
 
 		 617 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  23.81 
 
 		 617 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  23.81 
 
 		 617 aa  144  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  23.65 
 
 		 617 aa  144  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  23.65 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  23.65 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  23.65 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  23.49 
 
 		 617 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  23.61 
 
 		 615 aa  140  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  23.65 
 
 		 617 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  27.54 
 
 		 732 aa  137  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  24.07 
 
 		 611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  24.83 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  24.83 
 
 		 508 aa  135  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  24.92 
 
 		 611 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  28.27 
 
 		 677 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  21.24 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  21.24 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  21.24 
 
 		 618 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  22.31 
 
 		 611 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  22.31 
 
 		 618 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  22.31 
 
 		 618 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  22.31 
 
 		 618 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  22.15 
 
 		 618 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  22.39 
 
 		 725 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.99 
 
 		 618 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.85 
 
 		 640 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  23.78 
 
 		 705 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  23.04 
 
 		 599 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  22.51 
 
 		 747 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  28.48 
 
 		 655 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  23.63 
 
 		 748 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  22.62 
 
 		 740 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  23.35 
 
 		 656 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  23.39 
 
 		 649 aa  98.6  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  26.62 
 
 		 794 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  23.02 
 
 		 748 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  22.99 
 
 		 748 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  26.02 
 
 		 741 aa  97.4  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  28.32 
 
 		 789 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  25.61 
 
 		 602 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  27.69 
 
 		 649 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  28.63 
 
 		 826 aa  89  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  26.86 
 
 		 675 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  22.27 
 
 		 750 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  26.22 
 
 		 660 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  26.22 
 
 		 660 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  22.1 
 
 		 632 aa  84.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  23.57 
 
 		 646 aa  84.3  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  25.66 
 
 		 741 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  24.74 
 
 		 741 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  23.6 
 
 		 750 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  25.06 
 
 		 745 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  28.19 
 
 		 711 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  25.15 
 
 		 599 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  25.66 
 
 		 611 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  21.51 
 
 		 604 aa  73.9  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  25.34 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  22.34 
 
 		 762 aa  73.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  29.69 
 
 		 506 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  24.33 
 
 		 1013 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  20.67 
 
 		 656 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  21.75 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  26.23 
 
 		 701 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  20.49 
 
 		 648 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  23.94 
 
 		 748 aa  67.8  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1428  hypothetical protein  23.67 
 
 		 711 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  19.9 
 
 		 645 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  22.29 
 
 		 677 aa  65.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  22.94 
 
 		 654 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>