More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1987 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 253 aa  517  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  65.87 
 
 		 257 aa  344  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  63.04 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  64.29 
 
 		 255 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  62.65 
 
 		 258 aa  325  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  62.65 
 
 		 258 aa  324  9e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  62.65 
 
 		 258 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  62.85 
 
 		 266 aa  323  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  62.65 
 
 		 258 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  62.65 
 
 		 258 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  62.45 
 
 		 266 aa  322  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  62.65 
 
 		 258 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  62.85 
 
 		 280 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  62.06 
 
 		 266 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  61.66 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  60.71 
 
 		 262 aa  316  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  58.23 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  42.8 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  43.98 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  42.11 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  42.26 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  38.28 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  41 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  41 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  41 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  41.04 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  39.09 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  38.21 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  38.84 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  40.82 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  40.82 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  40.82 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  40.82 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  41.06 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  41.06 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  41.06 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  41.06 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  40.65 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  39 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  38.25 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  38.68 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  40.41 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  38.58 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  39.59 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  37.34 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  39.59 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  38 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  36.25 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  36.14 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  36.9 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  35.4 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  35.32 
 
 		 268 aa  155  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  38.5 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.65 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  34.8 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  34.71 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  33.6 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  34.16 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  33.48 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.55 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  32.93 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  27.13 
 
 		 306 aa  85.9  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.23 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.84 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.84 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.59 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.59 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.13 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.35 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.51 
 
 		 380 aa  75.5  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.43 
 
 		 368 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>