More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1978 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1978  ATPase  100 
 
 		 285 aa  596  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  62.79 
 
 		 260 aa  342  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  62.85 
 
 		 260 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  60.32 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  60.32 
 
 		 260 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3194  ATPase  60.08 
 
 		 260 aa  328  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  60.47 
 
 		 271 aa  325  6e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  56.92 
 
 		 270 aa  315  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.7 
 
 		 266 aa  308  6.999999999999999e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  60.58 
 
 		 277 aa  308  8e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.67 
 
 		 286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  53.79 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  57.09 
 
 		 270 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  55.34 
 
 		 285 aa  302  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.85 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  53.85 
 
 		 267 aa  300  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  58.5 
 
 		 275 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  53.03 
 
 		 268 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  54.55 
 
 		 272 aa  298  9e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.55 
 
 		 272 aa  298  9e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58 
 
 		 271 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  54.55 
 
 		 268 aa  297  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  51.81 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  54.94 
 
 		 265 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.26 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  56.02 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  54.22 
 
 		 265 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  52.17 
 
 		 269 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  54.22 
 
 		 265 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  52.96 
 
 		 268 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  51.56 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  51.38 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  51.38 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  53.75 
 
 		 272 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  51.37 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  50.99 
 
 		 267 aa  288  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  50.97 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  51.38 
 
 		 267 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  52.96 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  56.4 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  52.99 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.52 
 
 		 271 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  52.53 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  51.72 
 
 		 279 aa  285  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  54.15 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  52.53 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  52.17 
 
 		 273 aa  285  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  52.53 
 
 		 282 aa  285  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  51.78 
 
 		 278 aa  285  7e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  50.37 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  56.4 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  50.59 
 
 		 266 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  50.57 
 
 		 280 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  54.37 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  50.73 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.2 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  49.8 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  52.92 
 
 		 270 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  55.2 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  48.83 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  48.83 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  49.41 
 
 		 267 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  53.36 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  53.36 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  53.36 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  55.6 
 
 		 269 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  49.41 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  51.38 
 
 		 270 aa  275  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  52.78 
 
 		 265 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  52.99 
 
 		 272 aa  275  9e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  50.2 
 
 		 271 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  49.41 
 
 		 268 aa  271  6e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  52.17 
 
 		 282 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  50.99 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  49.8 
 
 		 266 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  48.99 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  48.99 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  47.39 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  47.39 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  47.01 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.27 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.33 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  30.27 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  30.27 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.46 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  35.58 
 
 		 4917 aa  99.4  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.72 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.2 
 
 		 290 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  34.81 
 
 		 4979 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  30.87 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  35.16 
 
 		 4844 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  27.27 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  30 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23838  predicted protein  36.91 
 
 		 1879 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  29.25 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  30 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  30 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  29.45 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  30 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  30 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>