More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1950 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  59.53 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  58.53 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  58.29 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  56.94 
 
 		 227 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  59.42 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  59.71 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  59.22 
 
 		 224 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  59.05 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  59.05 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  59.05 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  59.05 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  59.22 
 
 		 224 aa  241  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  56.07 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  50.22 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  53.57 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  45.75 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  42.03 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  40.82 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  39.7 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  39.7 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  38.43 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  40.4 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  39.05 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  38.05 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  39.13 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  36.99 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  39.5 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  40.91 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  39 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  38.73 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  42 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  39.7 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  38.68 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  38.69 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  36.74 
 
 		 238 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  36.87 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  37.69 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  42.36 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  37.21 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  37.21 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  38.69 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  38.69 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  36.24 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  38.19 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  35.78 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  38.32 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  36.82 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  38 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  38 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  41 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  35.08 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  36.18 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  37.88 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  33.63 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 235 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  34.09 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  32.86 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  32.08 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.8 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  31.1 
 
 		 252 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>