More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1911 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4796  hypothetical protein  51.94 
 
 
695 aa  724    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2223  peptidase, putative  78.31 
 
 
687 aa  1132    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2374  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  78.77 
 
 
683 aa  1132    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000964211  normal  0.238818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2228  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.96 
 
 
684 aa  1102    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0618866  hitchhiker  0.00768249 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.67 
 
 
684 aa  1117    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2039  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  75.84 
 
 
683 aa  1129    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.033765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.92 
 
 
683 aa  1134    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000111098  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1911  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  100 
 
 
683 aa  1426    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000149858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1385  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  46.72 
 
 
688 aa  635    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2123  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.38 
 
 
687 aa  1139    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2199  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.26 
 
 
687 aa  1137    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000634977  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2155  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  83.31 
 
 
686 aa  1224    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000413371  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.92 
 
 
683 aa  1134    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000205903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0881  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.04 
 
 
709 aa  648    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  78.59 
 
 
687 aa  1137    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000361808  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1808  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  77.31 
 
 
687 aa  1144    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1919  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  79.15 
 
 
682 aa  1134    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000323792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1905  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  74.67 
 
 
685 aa  1104    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82841  hitchhiker  0.0000502877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1689  peptidase, putative  75.44 
 
 
684 aa  1105    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.163482  normal  0.0910098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02099  alanyl dipeptidyl peptidase  45.52 
 
 
713 aa  630  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2696  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.07 
 
 
720 aa  628  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8559  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3102  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.14 
 
 
700 aa  626  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.245762 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1455  alanyl dipeptidyl peptidase  46.12 
 
 
717 aa  626  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1094  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.74 
 
 
680 aa  615  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.764126  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1091  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.28 
 
 
692 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  44.08 
 
 
668 aa  533  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0184  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.9 
 
 
698 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  36.17 
 
 
674 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.72 
 
 
674 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.43 
 
 
674 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4193  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34 
 
 
688 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259535  normal  0.164737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0118  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.36 
 
 
687 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125913  normal  0.195999 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  33.53 
 
 
648 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0591  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.18 
 
 
675 aa  364  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  33.04 
 
 
675 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.75 
 
 
680 aa  357  5e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.36 
 
 
681 aa  355  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.8 
 
 
675 aa  353  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.5 
 
 
681 aa  353  8e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.22 
 
 
681 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  33.03 
 
 
688 aa  348  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.88 
 
 
675 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.98 
 
 
681 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.22 
 
 
698 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.22 
 
 
673 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.07 
 
 
673 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30 
 
 
690 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00800  peptidase, putative  31.28 
 
 
750 aa  325  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.09 
 
 
698 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0636  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.38 
 
 
633 aa  316  9.999999999999999e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10198  oligopeptidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04730)  33.8 
 
 
729 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.59 
 
 
633 aa  303  9e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02572  hypothetical dipeptidyl-peptidase (Eurofung)  31.1 
 
 
722 aa  294  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.459981  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.95 
 
 
668 aa  273  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.9 
 
 
695 aa  270  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.99 
 
 
668 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0956  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.7 
 
 
672 aa  251  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.03 
 
 
697 aa  242  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.68 
 
 
688 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.68 
 
 
666 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.533433  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.53 
 
 
666 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0779604  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3633  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
666 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3954  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.51 
 
 
694 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.871148  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.7 
 
 
673 aa  233  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.22 
 
 
670 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.45 
 
 
700 aa  224  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.955873  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.9 
 
 
678 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.09 
 
 
652 aa  214  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.11 
 
 
661 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.6 
 
 
716 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.76 
 
 
680 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.62 
 
 
667 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.8 
 
 
704 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.34 
 
 
677 aa  197  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.86 
 
 
709 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.65 
 
 
717 aa  189  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.34 
 
 
720 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0116  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.23 
 
 
726 aa  181  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01350  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.61 
 
 
721 aa  181  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.62 
 
 
686 aa  181  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.11 
 
 
708 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.1 
 
 
735 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.31 
 
 
766 aa  172  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1655  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.56 
 
 
692 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.34 
 
 
695 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.8 
 
 
697 aa  171  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.84 
 
 
682 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  25.61 
 
 
698 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.65 
 
 
762 aa  165  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.85 
 
 
692 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28910  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  38.21 
 
 
719 aa  161  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487032  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.19 
 
 
660 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0490  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  23.87 
 
 
729 aa  157  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.03 
 
 
661 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  23.61 
 
 
704 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  26.06 
 
 
632 aa  151  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  23.63 
 
 
685 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24510  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  24.79 
 
 
712 aa  150  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.16 
 
 
822 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.82 
 
 
648 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>