More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1886 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  87.5 
 
 		 250 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  82.66 
 
 		 248 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  83.47 
 
 		 247 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  80.97 
 
 		 248 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  82.19 
 
 		 248 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  82.19 
 
 		 248 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  82.59 
 
 		 248 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  81.05 
 
 		 248 aa  421  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  82.59 
 
 		 248 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  83 
 
 		 248 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  80.97 
 
 		 248 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  80.97 
 
 		 248 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  80.97 
 
 		 248 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  78.63 
 
 		 248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  79.44 
 
 		 248 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  72.58 
 
 		 248 aa  370  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  70.85 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  70.45 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  70.45 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  70.85 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  70.85 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  70.85 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  70.85 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  70.85 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  70.04 
 
 		 246 aa  362  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  70.04 
 
 		 246 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  70.04 
 
 		 246 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  70.04 
 
 		 246 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  70.04 
 
 		 246 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  71.19 
 
 		 247 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  70.45 
 
 		 247 aa  359  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  69.64 
 
 		 246 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  70.04 
 
 		 247 aa  358  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  70.78 
 
 		 247 aa  358  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  70.04 
 
 		 247 aa  358  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  70.04 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  70.04 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  69.64 
 
 		 247 aa  354  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  70.45 
 
 		 246 aa  353  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  65.59 
 
 		 248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  66.4 
 
 		 248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  65.59 
 
 		 248 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  64.78 
 
 		 248 aa  329  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  64.78 
 
 		 246 aa  326  3e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  62.35 
 
 		 248 aa  321  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  61.13 
 
 		 248 aa  318  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  63.56 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  63.16 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  62.65 
 
 		 249 aa  316  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  64.92 
 
 		 249 aa  308  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  62.35 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  62.35 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  60.25 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  60.89 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  60.25 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  61.94 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  62.1 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  59.59 
 
 		 250 aa  301  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  59.04 
 
 		 249 aa  301  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  58.54 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  62.96 
 
 		 245 aa  295  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  61.85 
 
 		 249 aa  292  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  60.67 
 
 		 240 aa  291  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  61.45 
 
 		 249 aa  291  8e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  54.66 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  56.45 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  56.45 
 
 		 250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  53.85 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  54.66 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  54.66 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  53.44 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  54.25 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  53.04 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  53.63 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  57.32 
 
 		 239 aa  271  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  57.32 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  55.56 
 
 		 243 aa  271  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  56.9 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  54.66 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  56.9 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  53.23 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  55 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  53.31 
 
 		 247 aa  268  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  58.26 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  54.36 
 
 		 241 aa  265  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  58.26 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  55.65 
 
 		 239 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  53.01 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  51.39 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  54.81 
 
 		 239 aa  262  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  52.46 
 
 		 246 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  52.4 
 
 		 250 aa  258  6e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  51.23 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  56.85 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  51.61 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  49.2 
 
 		 251 aa  254  7e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  51.25 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2683  hypothetical protein  57.68 
 
 		 241 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0166157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  56.61 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>