45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1731 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1731  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2219  hypothetical protein  68.36 
 
 
177 aa  256  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2438  hypothetical protein  63.28 
 
 
177 aa  242  2e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2591  hypothetical protein  63.28 
 
 
177 aa  242  2e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2431  hypothetical protein  63.28 
 
 
177 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.146269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1913  protein of unknown function DUF1379  63.28 
 
 
177 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0618258  normal  0.219466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2551  hypothetical protein  63.28 
 
 
177 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0408424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2193  hypothetical protein  63.84 
 
 
177 aa  239  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1757  hypothetical protein  61.58 
 
 
177 aa  235  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0511465  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1682  hypothetical protein  61.58 
 
 
177 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0455206  normal  0.0971581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1787  hypothetical protein  61.58 
 
 
177 aa  234  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0844368  normal  0.271795 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1594  hypothetical protein  61.58 
 
 
177 aa  231  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.37237e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1944  hypothetical protein  60.34 
 
 
179 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2142  hypothetical protein  63.84 
 
 
181 aa  228  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.883221  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1811  hypothetical protein  61.58 
 
 
177 aa  224  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.37995e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2474  hypothetical protein  59.89 
 
 
177 aa  213  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.411375  hitchhiker  0.00395627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2062  protein of unknown function DUF1379  35.67 
 
 
195 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1111  hypothetical protein  35.29 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  7.98367e-07  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2697  protein of unknown function DUF1379  32.77 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.57658e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00957  hypothetical protein  32.77 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.3428e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1062  hypothetical protein  32.77 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.04596e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1055  hypothetical protein  32.77 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.52866e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2370  hypothetical protein  32.77 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  4.38094e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2650  hypothetical protein  32.77 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.22204e-08  hitchhiker  0.00136169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00950  hypothetical protein  32.77 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.81867e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2172  hypothetical protein  32.77 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.20846e-10  normal  0.548871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1741  hypothetical protein  35.84 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0888818  normal  0.0230313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1458  hypothetical protein  33.14 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00224961  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1100  hypothetical protein  32.54 
 
 
180 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  2.78688e-05  normal  0.979785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1017  hypothetical protein  32.54 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1121  hypothetical protein  32.54 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  2.0025e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1168  hypothetical protein  32.54 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  4.48874e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1647  protein of unknown function DUF1379  34.09 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2554  hypothetical protein  32.94 
 
 
183 aa  83.6  1e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1550  hypothetical protein  32.12 
 
 
196 aa  83.6  1e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2643  hypothetical protein  32.94 
 
 
183 aa  83.6  1e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.284098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1678  protein of unknown function DUF1379  33.14 
 
 
184 aa  83.2  2e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.439377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1789  hypothetical protein  33.73 
 
 
195 aa  82.8  2e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1134  hypothetical protein  31.95 
 
 
180 aa  83.2  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  9.82581e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1985  hypothetical protein  32.35 
 
 
183 aa  80.9  9e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003437  hypothetical protein  32.73 
 
 
180 aa  79.3  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1097  hypothetical protein  32.12 
 
 
180 aa  76.3  2e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02338  hypothetical protein  32.12 
 
 
180 aa  73.6  1e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2004  hypothetical protein  31.18 
 
 
178 aa  65.5  4e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0401483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2298  hypothetical protein  26.83 
 
 
188 aa  52  4e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>