275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1661 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1661  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1478  dithiobiotin synthetase  60.68 
 
 		 236 aa  276  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  62.26 
 
 		 221 aa  262  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2516  dithiobiotin synthetase  57.98 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000238987 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2428  dithiobiotin synthetase  57.14 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0142166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2356  dithiobiotin synthetase  56.72 
 
 		 231 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1798  dithiobiotin synthetase  55.65 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121118  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2737  dithiobiotin synthetase  57.56 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2342  dithiobiotin synthetase  56.45 
 
 		 247 aa  244  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1761  dithiobiotin synthetase  56.05 
 
 		 246 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2524  dithiobiotin synthetase  55.24 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.161209  normal  0.3539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1754  dithiobiotin synthetase  55.65 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.235022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  53.16 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1869  dethiobiotin synthase  51.95 
 
 		 222 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  decreased coverage  0.000000281099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1722  dethiobiotin synthase  53.81 
 
 		 237 aa  228  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000192281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1441  dithiobiotin synthetase  53.39 
 
 		 230 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00254947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  46.75 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  49.57 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0498  dethiobiotin synthetase  49.57 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  49.13 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0366  dithiobiotin synthetase  47.39 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.55843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0392  dithiobiotin synthetase  47.39 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4836  dithiobiotin synthetase  46.09 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.519377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  46.52 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  47.08 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  46.96 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  48.02 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45930  dithiobiotin synthetase  47.14 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  44.69 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  48.34 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  44.78 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  42.67 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06570  dithiobiotin synthetase  46.09 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01810  dithiobiotin synthetase  41.81 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2554  dethiobiotin synthase  42.98 
 
 		 287 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0309873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0604  dithiobiotin synthetase  47.89 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  42.61 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  43.04 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  43.46 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  43.29 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  46.73 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  42.59 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  43.04 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  42.42 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0857  dithiobiotin synthetase  39.39 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  42.61 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2284  dethiobiotin synthase  40.34 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.165561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02208  cobyrinic acid a,c-diamide synthase:dethiobiotin synthase  44.14 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.020926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  42.42 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  42.42 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  42.42 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  42.42 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  42.42 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  41.99 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  41.99 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  42.86 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  42.11 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  40.69 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  40.25 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1580  dithiobiotin synthetase  44.19 
 
 		 270 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0294479  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1895  putative dithiobiotin synthetase  41.63 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  40.53 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  42.13 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  42.13 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1637  dithiobiotin synthetase  43.72 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  41.7 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  41.7 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  41.7 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  38.43 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2346  putative dithiobiotin synthetase  41.03 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2132  putative dithiobiotin synthetase  39.91 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1591  putative dithiobiotin synthetase  39.48 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0571345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1683  putative dithiobiotin synthetase  39.48 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.809322  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1659  putative dithiobiotin synthetase  39.48 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2597  dethiobiotin synthase  39.74 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.204799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1980  putative dithiobiotin synthetase  37.83 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1868  putative dithiobiotin synthetase  37.83 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2045  putative dithiobiotin synthetase  41.13 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.154785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01562  predicted dethiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2050  dethiobiotin synthase  40.43 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.583234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2302  putative dithiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1667  putative dithiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2037  putative dithiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1920  putative dithiobiotin synthetase  40.79 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01552  hypothetical protein  40.43 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1850  putative dithiobiotin synthetase  39.06 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1600  putative dithiobiotin synthetase  39.06 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1799  putative dithiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1778  putative dithiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1608  putative dithiobiotin synthetase  40.43 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  38.77 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0292  dethiobiotin synthase  41.13 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0765643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0959  dethiobiotin synthase  42.48 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0323  dethiobiotin synthase  41.01 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  41.4 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  37.92 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  41.98 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  39.39 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  38.24 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  41.1 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>