More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1597 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  78.51 
 
 		 725 aa  1175    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  76.68 
 
 		 729 aa  1148    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  76.37 
 
 		 734 aa  1157    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  53.73 
 
 		 714 aa  757    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  77.69 
 
 		 726 aa  1198    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  50.81 
 
 		 848 aa  700    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  76.5 
 
 		 734 aa  1159    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  100 
 
 		 726 aa  1506    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  57.54 
 
 		 736 aa  836    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.93 
 
 		 689 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  76.5 
 
 		 734 aa  1157    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  78.34 
 
 		 742 aa  1177    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  78.07 
 
 		 742 aa  1169    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  74.38 
 
 		 727 aa  1146    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  78.34 
 
 		 742 aa  1176    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  76.5 
 
 		 734 aa  1157    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  69.32 
 
 		 730 aa  1054    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  77.96 
 
 		 726 aa  1186    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  48.64 
 
 		 675 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  46.24 
 
 		 709 aa  621  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.17 
 
 		 723 aa  616  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.42 
 
 		 683 aa  617  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.87 
 
 		 716 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.61 
 
 		 716 aa  611  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.7 
 
 		 717 aa  612  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.41 
 
 		 689 aa  609  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.53 
 
 		 716 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.76 
 
 		 723 aa  608  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.77 
 
 		 711 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.38 
 
 		 712 aa  608  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.31 
 
 		 716 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.36 
 
 		 716 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  45.8 
 
 		 685 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.66 
 
 		 716 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.66 
 
 		 716 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.24 
 
 		 687 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.52 
 
 		 716 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  43.85 
 
 		 722 aa  599  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  44.64 
 
 		 693 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.2 
 
 		 714 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.21 
 
 		 689 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.29 
 
 		 718 aa  591  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.13 
 
 		 699 aa  592  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.33 
 
 		 694 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.24 
 
 		 722 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.13 
 
 		 696 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.71 
 
 		 696 aa  588  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.96 
 
 		 699 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.74 
 
 		 712 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.06 
 
 		 716 aa  587  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.64 
 
 		 683 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.1 
 
 		 696 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.27 
 
 		 716 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.35 
 
 		 733 aa  578  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0446  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.99 
 
 		 699 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.428364  normal  0.240346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  44.25 
 
 		 674 aa  573  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.13 
 
 		 695 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  44.06 
 
 		 692 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  41.92 
 
 		 694 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.13 
 
 		 696 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.22 
 
 		 718 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.89 
 
 		 695 aa  568  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.13 
 
 		 695 aa  572  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.97 
 
 		 717 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.78 
 
 		 718 aa  572  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.12 
 
 		 717 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  44.33 
 
 		 671 aa  564  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.02 
 
 		 681 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.35 
 
 		 677 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1628  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.63 
 
 		 681 aa  560  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356686  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.36 
 
 		 682 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.64 
 
 		 720 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.87 
 
 		 716 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2120  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.48 
 
 		 681 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000189096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1702  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.48 
 
 		 681 aa  557  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0043073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.56 
 
 		 680 aa  558  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2154  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.63 
 
 		 681 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000542867  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01497  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.48 
 
 		 681 aa  555  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000554972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1627  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.33 
 
 		 681 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000101595  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2107  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.48 
 
 		 681 aa  555  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1747  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.48 
 
 		 681 aa  555  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000176461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.72 
 
 		 711 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01508  hypothetical protein  42.48 
 
 		 681 aa  555  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000866306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.82 
 
 		 718 aa  555  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.23 
 
 		 714 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.51 
 
 		 682 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.43 
 
 		 714 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.66 
 
 		 714 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.63 
 
 		 714 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.48 
 
 		 714 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.84 
 
 		 691 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1624  dipeptidyl carboxypeptidase II  41.21 
 
 		 680 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.36 
 
 		 733 aa  545  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1683  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.92 
 
 		 680 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.897722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1659  dipeptidyl carboxypeptidase II  41.06 
 
 		 680 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.037506  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2016  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.94 
 
 		 697 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.35 
 
 		 715 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.21 
 
 		 715 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1615  dipeptidyl carboxypeptidase II  41.06 
 
 		 680 aa  542  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.418466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.35 
 
 		 715 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>