More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1553 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  100 
 
 
265 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  89.43 
 
 
278 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  89.43 
 
 
278 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  88.68 
 
 
265 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  88.68 
 
 
265 aa  502  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  88.3 
 
 
265 aa  500  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  89.06 
 
 
278 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  87.97 
 
 
278 aa  493  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  86.84 
 
 
268 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  86.84 
 
 
268 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  86.84 
 
 
268 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  86.84 
 
 
268 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  84.53 
 
 
265 aa  485  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  86.42 
 
 
266 aa  481  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  84.53 
 
 
265 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  83.83 
 
 
266 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  70.61 
 
 
280 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1550  methionine aminopeptidase  70.3 
 
 
262 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2428  methionine aminopeptidase  66.79 
 
 
275 aa  381  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03238  methionine aminopeptidase  60.48 
 
 
292 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002745  methionine aminopeptidase  60.14 
 
 
292 aa  363  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0499689  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  61.8 
 
 
262 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  62.45 
 
 
263 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  63.57 
 
 
264 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  58.96 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  58.96 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
263 aa  318  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
263 aa  318  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  61.54 
 
 
270 aa  315  6e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  61.54 
 
 
258 aa  315  6e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  60.61 
 
 
260 aa  314  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  59.85 
 
 
261 aa  314  8e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  60.23 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  56.34 
 
 
264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  57.84 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  57.46 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  57.46 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  57.46 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  57.46 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  57.46 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  60.98 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  60.23 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  57.46 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
264 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  55.6 
 
 
264 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0526  methionine aminopeptidase  57.62 
 
 
264 aa  309  2e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  56.34 
 
 
264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  58.69 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  58.69 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  58.08 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  59.16 
 
 
258 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  59.85 
 
 
260 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  60.38 
 
 
260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  59.23 
 
 
260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  58.71 
 
 
260 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  58.71 
 
 
260 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  58.71 
 
 
260 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  59.32 
 
 
256 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  58.33 
 
 
260 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  58.49 
 
 
260 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  57.63 
 
 
255 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  56.15 
 
 
267 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
260 aa  291  6e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0562  methionine aminopeptidase, type I  57.89 
 
 
263 aa  291  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  56.03 
 
 
255 aa  288  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  57.03 
 
 
266 aa  287  1e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  55.56 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  56.64 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  56.92 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  56.15 
 
 
266 aa  285  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  56.3 
 
 
284 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  53.85 
 
 
269 aa  281  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  54.3 
 
 
269 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  54.3 
 
 
269 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  52.87 
 
 
267 aa  281  8.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1271  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 
285 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0521675  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  52.9 
 
 
266 aa  277  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0396  methionine aminopeptidase, type I  52.69 
 
 
264 aa  276  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 
267 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  55.08 
 
 
258 aa  276  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1339  methionine aminopeptidase  54.58 
 
 
270 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89837  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0442  methionine aminopeptidase, type I  52.69 
 
 
264 aa  276  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  54.48 
 
 
278 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  54.15 
 
 
262 aa  275  5e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  54.86 
 
 
259 aa  275  7e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1556  methionine aminopeptidase  55.38 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2495  methionine aminopeptidase  55.38 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3253  methionine aminopeptidase  55.38 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1330  methionine aminopeptidase  55.38 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.122814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2438  methionine aminopeptidase  55.38 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2058  methionine aminopeptidase  55.38 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.118256  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  54.47 
 
 
259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>