More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1530 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2637  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.2 
 
 
714 aa  820  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2760  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  83.57 
 
 
706 aa  1174  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3026  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  78.37 
 
 
713 aa  1099  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144673  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0565  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.95 
 
 
708 aa  779  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.486274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2459  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  83 
 
 
706 aa  1169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.740158  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2721  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.92 
 
 
714 aa  815  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2881  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.57 
 
 
715 aa  830  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452872  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  64.35 
 
 
717 aa  913  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2425  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  78.75 
 
 
706 aa  1090  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2577  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.77 
 
 
715 aa  825  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.797066  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2630  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.77 
 
 
715 aa  826  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.27424e-09 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1733  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  46.91 
 
 
744 aa  658  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.535937  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2780  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  83.71 
 
 
706 aa  1177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4162  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  50.92 
 
 
723 aa  652  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1629  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  81.37 
 
 
715 aa  1143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.895951  normal  0.0132209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3378  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.55 
 
 
721 aa  807  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2855  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  83.57 
 
 
706 aa  1174  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0382  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.75 
 
 
775 aa  797  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2492  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.92 
 
 
714 aa  840  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1530  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  100 
 
 
708 aa  1440  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03120  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.31 
 
 
704 aa  771  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1400  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.75 
 
 
747 aa  796  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1509  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.89 
 
 
774 aa  800  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.807341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1312  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.64 
 
 
714 aa  812  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.474156  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2500  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.78 
 
 
714 aa  813  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273227  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2617  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.49 
 
 
715 aa  823  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595901  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02700  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  62.3 
 
 
719 aa  874  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02265  fused enoyl-CoA hydratase and epimerase and isomerase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  57.2 
 
 
714 aa  816  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2597  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  52.93 
 
 
714 aa  705  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02226  hypothetical protein  57.2 
 
 
714 aa  816  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3088  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  82.53 
 
 
707 aa  1152  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1341  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  53.57 
 
 
732 aa  714  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2167  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  81.87 
 
 
706 aa  1130  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359385  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3156  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  62.14 
 
 
764 aa  869  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0879697  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2821  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.74 
 
 
727 aa  786  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1444  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.46 
 
 
727 aa  772  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1461  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  82.65 
 
 
709 aa  1154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.22255e-05 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3456  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  47.96 
 
 
752 aa  679  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0405944 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1316  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  57.06 
 
 
714 aa  815  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002857  fatty oxidation complex alpha subunit FadJ  56.88 
 
 
703 aa  781  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  85.59 
 
 
710 aa  1205  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  79.92 
 
 
706 aa  1116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2528  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.77 
 
 
715 aa  826  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  53.19 
 
 
714 aa  731  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1473  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  82.23 
 
 
709 aa  1151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.451706  normal  0.0332103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  82.37 
 
 
709 aa  1151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.682572  hitchhiker  0.000547588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2742  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.49 
 
 
715 aa  822  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269635  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3484  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.2 
 
 
714 aa  819  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.591904  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  83.71 
 
 
706 aa  1177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  5.61354e-05 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  49.79 
 
 
724 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  49.65 
 
 
725 aa  632  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0437  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  49.22 
 
 
725 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  41.88 
 
 
702 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35240  predicted protein  43.82 
 
 
684 aa  525  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.89 
 
 
724 aa  505  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110209  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0125  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.51 
 
 
732 aa  469  1e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0543  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.49 
 
 
736 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247405  normal  0.0940574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0465  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.62 
 
 
750 aa  452  1e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4031  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.86 
 
 
738 aa  454  1e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0021  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.19 
 
 
740 aa  452  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0793  fatty oxidation complex, alpha subunit  37.59 
 
 
738 aa  448  1e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0887  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.99 
 
 
738 aa  447  1e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.703103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  36.1 
 
 
738 aa  447  1e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5242  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.71 
 
 
733 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1144  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  39.15 
 
 
715 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00169331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1578  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.85 
 
 
716 aa  445  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0281049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3437  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.81 
 
 
733 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.218368  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0807  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.65 
 
 
738 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3565  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.35 
 
 
733 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38918  normal  0.164107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3879  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  40.08 
 
 
715 aa  441  1e-122  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3281  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.1 
 
 
733 aa  441  1e-122  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.740895  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0744  fatty oxidation complex, alpha subunit  37.31 
 
 
738 aa  442  1e-122  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3241  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.21 
 
 
733 aa  441  1e-122  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.736069  normal  0.0839806 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.64 
 
 
719 aa  439  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0735  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.36 
 
 
738 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0144  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36 
 
 
736 aa  438  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.258925 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0597  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 
737 aa  432  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25080  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  39.57 
 
 
715 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0817  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  36.19 
 
 
737 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1580  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.8 
 
 
715 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120976  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2136  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.33 
 
 
715 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.434411  normal  0.123544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.47 
 
 
715 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.281306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1652  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.61 
 
 
715 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2145  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  39.43 
 
 
715 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3290  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.28 
 
 
721 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0906182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3606  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.33 
 
 
715 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.28427 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1562  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  36.34 
 
 
733 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150741  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0244  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.59 
 
 
737 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3852  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.89 
 
 
708 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0006  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.31 
 
 
733 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670194  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0062  fatty oxidation complex, alpha subunit  39.35 
 
 
707 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4929  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.89 
 
 
708 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.504064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3517  fatty oxidation complex, alpha subunit  38.59 
 
 
721 aa  426  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.330047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2393  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.96 
 
 
727 aa  422  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0287  fatty oxidation complex, alpha subunit  39.41 
 
 
707 aa  417  1e-115  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0073  putative 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  39.41 
 
 
707 aa  417  1e-115  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7186  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  39.09 
 
 
715 aa  416  1e-115  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.0336764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0216  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.86 
 
 
737 aa  417  1e-115  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.97632  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0075  putative 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  39.41 
 
 
707 aa  417  1e-115  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3485  fatty oxidation complex, alpha subunit  39.27 
 
 
707 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>