82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1441 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  30.46 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  27.27 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  27.24 
 
 
365 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  26.8 
 
 
334 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  29.89 
 
 
372 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  27.14 
 
 
374 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  25.91 
 
 
348 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  32.05 
 
 
605 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  25.82 
 
 
348 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  27.14 
 
 
348 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  25.61 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  22.94 
 
 
341 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  28.9 
 
 
546 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  25.63 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  24.22 
 
 
347 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  25.88 
 
 
346 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  24.48 
 
 
342 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  25.83 
 
 
330 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  25.49 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  26.09 
 
 
600 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  24.63 
 
 
345 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  26.09 
 
 
600 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  24.36 
 
 
569 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  26.67 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  25.45 
 
 
568 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  23.51 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  28.21 
 
 
572 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  22.76 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  27.71 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  28.06 
 
 
572 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  24.57 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.24 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  25 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  24.71 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  23.81 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  22.46 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  26.79 
 
 
571 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  24.4 
 
 
551 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.08 
 
 
547 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  29.5 
 
 
568 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  27.2 
 
 
567 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  24.15 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  23.26 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  21.31 
 
 
330 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  26.21 
 
 
607 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  23.31 
 
 
565 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.04 
 
 
567 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  24.14 
 
 
601 aa  59.7  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  22.91 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  25.88 
 
 
498 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  30.91 
 
 
146 aa  59.7  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  31.3 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  26.52 
 
 
498 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  22.92 
 
 
476 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  24.58 
 
 
380 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  24.07 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  24.51 
 
 
410 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  24.33 
 
 
316 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.72 
 
 
505 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  21.93 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  25.2 
 
 
302 aa  55.8  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  26.09 
 
 
542 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  27.51 
 
 
533 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  21.89 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  21.89 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  23.27 
 
 
543 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  21.89 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  24.12 
 
 
382 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  23.28 
 
 
410 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1961  hypothetical protein  25.85 
 
 
524 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  21.07 
 
 
339 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  22.26 
 
 
341 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  23.05 
 
 
570 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  22.38 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  22.85 
 
 
439 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.14 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  21.59 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  27.92 
 
 
526 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3795  hypothetical protein  25.48 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.394583 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  33.04 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.43 
 
 
430 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>