159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1415 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1415  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00105973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2446  hypothetical protein  68.9 
 
 		 169 aa  249  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.382195  hitchhiker  0.00000000481223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2516  hypothetical protein  68.9 
 
 		 169 aa  249  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2700  protein of unknown function DUF45  68.67 
 
 		 174 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0148854  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2608  hypothetical protein  68.29 
 
 		 169 aa  246  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.353391  hitchhiker  0.0000000267232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1643  hypothetical protein  68.67 
 
 		 174 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00239821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1680  hypothetical protein  68.67 
 
 		 174 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0855822  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2447  hypothetical protein  67.07 
 
 		 199 aa  245  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2840  hypothetical protein  67.07 
 
 		 173 aa  243  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1658  hypothetical protein  69.33 
 
 		 170 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268756  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1535  hypothetical protein  66.87 
 
 		 169 aa  238  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.156288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2626  hypothetical protein  64.02 
 
 		 168 aa  224  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1592  hypothetical protein  65.1 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.18877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3056  hypothetical protein  63.86 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  hitchhiker  0.00906067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2454  hypothetical protein  62.91 
 
 		 168 aa  202  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.542737  unclonable  0.00000219257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1271  hypothetical protein  58.39 
 
 		 165 aa  201  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0250  hypothetical protein  54.88 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3432  protein of unknown function DUF45  58.44 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000422395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0829  protein of unknown function DUF45  58.06 
 
 		 170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0180  hypothetical protein  53.66 
 
 		 169 aa  194  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0188  hypothetical protein  58.94 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3023  hypothetical protein  58.44 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0136  hypothetical protein  53.9 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1222  hypothetical protein  53.46 
 
 		 170 aa  187  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2775  hypothetical protein  55.09 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.828021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1539  hypothetical protein  53.12 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3293  hypothetical protein  53.9 
 
 		 179 aa  183  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0616  protein of unknown function DUF45  54.09 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.903914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0615  hypothetical protein  54.43 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1390  hypothetical protein  53.25 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3521  hypothetical protein  54.43 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3377  hypothetical protein  54.43 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3267  hypothetical protein  54.43 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3552  hypothetical protein  54.43 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.393221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4195  hypothetical protein  54.09 
 
 		 175 aa  178  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4315  hypothetical protein  54.97 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4399  hypothetical protein  54.43 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.255986  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02954  predicted metal dependent hydrolase  54.43 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02904  hypothetical protein  54.43 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3622  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2641  protein of unknown function DUF45  49.69 
 
 		 167 aa  174  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1039  hypothetical protein  50.63 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3412  hypothetical protein  52.87 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3408  hypothetical protein  52.87 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07290  hypothetical protein  51.57 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.303168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3516  hypothetical protein  52.87 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503461  hitchhiker  0.0000110103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3578  hypothetical protein  52.87 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3482  hypothetical protein  52.87 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0664  hypothetical protein  50.94 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0789398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5254  hypothetical protein  50.94 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003680  hypothetical protein  48.39 
 
 		 171 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1408  protein of unknown function DUF45  50.32 
 
 		 177 aa  168  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3223  hypothetical protein  49.06 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02144  hypothetical protein  47.74 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1134  hypothetical protein  47.85 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0510  hypothetical protein  49.06 
 
 		 174 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0508  hypothetical protein  50.94 
 
 		 166 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5007  hypothetical protein  50.31 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.311792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5013  hypothetical protein  47.53 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3068  hypothetical protein  49.06 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1485  hypothetical protein  48.43 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.991457  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3541  hypothetical protein  50.99 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0466  hypothetical protein  46.91 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0498  hypothetical protein  52.32 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1097  hypothetical protein  52.32 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0560  hypothetical protein  52.32 
 
 		 169 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4958  hypothetical protein  50.31 
 
 		 179 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3055  hypothetical protein  49.35 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4831  hypothetical protein  50.31 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2061  hypothetical protein  52.78 
 
 		 174 aa  163  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0980857  normal  0.354164 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01747  hypothetical protein  49.35 
 
 		 175 aa  162  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1783  hypothetical protein  48.39 
 
 		 189 aa  161  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2650  hypothetical protein  50.99 
 
 		 203 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.701907  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3505  hypothetical protein  46.1 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05640  hypothetical protein  47.5 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3643  protein of unknown function DUF45  44.44 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2949  protein of unknown function DUF45  46.1 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0062  protein of unknown function DUF45  47.13 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1484  hypothetical protein  49.38 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1839  hypothetical protein  46.75 
 
 		 162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00369136  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2868  hypothetical protein  46.71 
 
 		 171 aa  150  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1608  hypothetical protein  46.1 
 
 		 162 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000317368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2355  protein of unknown function DUF45  46.71 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.202802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02667  hypothetical protein  43.56 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.447659  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0142  putative metal-dependent hydrolase  49.26 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1213  protein of unknown function DUF45  45.27 
 
 		 168 aa  147  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0130  hypothetical protein  41.4 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0173602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  31.03 
 
 		 316 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  31.03 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  31.03 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  31.03 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  31.03 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  31.03 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>