More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1398 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  100 
 
 		 289 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  70.24 
 
 		 289 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  66.44 
 
 		 289 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  67.47 
 
 		 289 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  67.47 
 
 		 289 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  67.47 
 
 		 289 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  67.13 
 
 		 290 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  66.78 
 
 		 290 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  67.47 
 
 		 289 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  66.78 
 
 		 290 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  65.59 
 
 		 286 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  61.94 
 
 		 297 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  61.94 
 
 		 289 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  63.32 
 
 		 289 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  63.14 
 
 		 289 aa  384  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  46.32 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  46.5 
 
 		 291 aa  288  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  43.16 
 
 		 287 aa  278  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  41.2 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  38.75 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  39.66 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  40.64 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  73.77 
 
 		 122 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  36.06 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  33.92 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  29.72 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  29 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  27.88 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  28.92 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  27.53 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  26.99 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  27.78 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  26.5 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  26.5 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  26.5 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  25.8 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  27.24 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  26.8 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  28.22 
 
 		 295 aa  92  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  27.31 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.69 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  24.91 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  25.08 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  25.87 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  41.38 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  37 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  41.77 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35.65 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2246  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  decreased coverage  0.00792288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  41.38 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  30.91 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.85 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  30.91 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.62 
 
 		 330 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  43.02 
 
 		 229 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  30.84 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  33.9 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.38 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  34.86 
 
 		 890 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  36.89 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  29.29 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  40.51 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.51 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  20.42 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  36.56 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  29.84 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.96 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.96 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  42.47 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.39 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  30.48 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.78 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.66 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.55 
 
 		 623 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  30.48 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  35.35 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  34.26 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  37.66 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.19 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.26 
 
 		 607 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.1 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  33.05 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 		 679 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>