More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1358 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  100 
 
 		 209 aa  433  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  39.9 
 
 		 191 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  39.9 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  40.84 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  39.15 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  35.98 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  38.62 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  38.62 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  38.62 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  38.62 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  34.16 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  33.82 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.98 
 
 		 350 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  32.98 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.98 
 
 		 350 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 440 aa  93.2  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  33.17 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  33.89 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.9 
 
 		 544 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.9 
 
 		 542 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  32.78 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.78 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.51 
 
 		 344 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34.59 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 449 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 543 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.16 
 
 		 447 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  32.18 
 
 		 294 aa  88.2  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.14 
 
 		 420 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  32.43 
 
 		 344 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  32.43 
 
 		 344 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  32.97 
 
 		 344 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  31.52 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  31.89 
 
 		 351 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  32.43 
 
 		 344 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  31.89 
 
 		 345 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  32.61 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  34.41 
 
 		 337 aa  86.3  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  32.97 
 
 		 445 aa  85.5  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  34.22 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  31.55 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  33.33 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.35 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.16 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  32.5 
 
 		 623 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  38.57 
 
 		 352 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  30.88 
 
 		 429 aa  79  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  43.27 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  41.88 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  30.1 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  41.18 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  34.57 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  30.6 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  30.27 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  34.78 
 
 		 620 aa  76.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  32.97 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  32.07 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  47.19 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  30.73 
 
 		 401 aa  75.1  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1987 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  31.38 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  32.61 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  29.95 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  30.7 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  30.64 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  32.09 
 
 		 727 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50810  hypothetical protein  41.73 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  34.33 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1730  OmpA/MotB domain protein  34.67 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262216  normal  0.802647 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  28.72 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  25.53 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  36.19 
 
 		 669 aa  72.4  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  29.84 
 
 		 456 aa  72.4  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  41.94 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  30.89 
 
 		 402 aa  72  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  32.12 
 
 		 321 aa  72  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4332  hypothetical protein  40.94 
 
 		 293 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 523 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.68 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 440 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  29.57 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  27.42 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>