275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1338 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
267 aa  529  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  82.77 
 
 
267 aa  452  1e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  76.34 
 
 
265 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  76.72 
 
 
265 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  76.34 
 
 
265 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  75.57 
 
 
265 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  78.38 
 
 
265 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  75.95 
 
 
265 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  75.95 
 
 
265 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  75.95 
 
 
265 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  75.57 
 
 
265 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  74.81 
 
 
265 aa  418  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  77.73 
 
 
265 aa  399  1e-110  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  71.76 
 
 
266 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  70.23 
 
 
262 aa  384  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  71.94 
 
 
261 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  49.4 
 
 
260 aa  255  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  50.2 
 
 
260 aa  253  2e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  48.59 
 
 
260 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  45.38 
 
 
260 aa  243  2e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  47.08 
 
 
259 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  49.2 
 
 
260 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  46.03 
 
 
259 aa  221  1e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  44.3 
 
 
261 aa  213  3e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  44.8 
 
 
258 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  47.21 
 
 
258 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  43.6 
 
 
261 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  46.81 
 
 
261 aa  200  2e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  43.77 
 
 
258 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  41.08 
 
 
258 aa  196  4e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  44.81 
 
 
258 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  40.66 
 
 
258 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  39.83 
 
 
258 aa  184  1e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  42.01 
 
 
257 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  39.83 
 
 
258 aa  181  8e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  38.29 
 
 
260 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  39.91 
 
 
253 aa  179  3e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  37.9 
 
 
247 aa  179  5e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  37.55 
 
 
258 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  38.76 
 
 
261 aa  172  7e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  36.19 
 
 
260 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  35.02 
 
 
263 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  38.7 
 
 
262 aa  164  2e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  35.02 
 
 
259 aa  164  2e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  37.94 
 
 
265 aa  163  2e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  36.33 
 
 
261 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  33.08 
 
 
261 aa  162  5e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  33.47 
 
 
260 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  39.21 
 
 
260 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  35.86 
 
 
264 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  35.25 
 
 
260 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  35.25 
 
 
260 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  35.25 
 
 
260 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  35.02 
 
 
259 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  38.05 
 
 
258 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  38.94 
 
 
258 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  34.16 
 
 
260 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  40.19 
 
 
236 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  42.45 
 
 
266 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  36.44 
 
 
259 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  38.26 
 
 
260 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  36.89 
 
 
260 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  37.83 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  37.83 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  37.83 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  37.83 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.62 
 
 
256 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  37.83 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  37.83 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  31.84 
 
 
261 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  33.62 
 
 
256 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  36.96 
 
 
260 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  35.66 
 
 
260 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  33.88 
 
 
259 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  35.66 
 
 
260 aa  148  1e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  35.65 
 
 
260 aa  148  1e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  35.19 
 
 
260 aa  147  2e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  32.49 
 
 
257 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  35.22 
 
 
260 aa  145  7e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  34.44 
 
 
264 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  34.39 
 
 
261 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
261 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  35.68 
 
 
256 aa  140  2e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  34.68 
 
 
247 aa  140  2e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  36.04 
 
 
247 aa  140  2e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  34.25 
 
 
264 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  36.4 
 
 
264 aa  138  8e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  33.76 
 
 
260 aa  138  9e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  33.76 
 
 
260 aa  138  9e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1653  flagellar biosynthetic protein FliR  38.71 
 
 
266 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.314291  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  34.63 
 
 
261 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.55568e-06  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  36.4 
 
 
264 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.10874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3595  flagellar biosynthetic protein FliR  35.39 
 
 
259 aa  136  3e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  35.96 
 
 
264 aa  136  3e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  35.96 
 
 
264 aa  136  3e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  35.96 
 
 
264 aa  136  3e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  34.63 
 
 
261 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.14634e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  35.54 
 
 
261 aa  135  9e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.59397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  34.24 
 
 
261 aa  134  1e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.09979e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  36.21 
 
 
269 aa  133  4e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>