15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1280 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1280  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.483733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1150  hypothetical protein  45.1 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1248  hypothetical protein  44.24 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1298  hypothetical protein  46.18 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1318  hypothetical protein  45.64 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2985  hypothetical protein  42.9 
 
 		 314 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3129  hypothetical protein  42.58 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.161074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2633  hypothetical protein  40.59 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1392  hypothetical protein  42.58 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.829307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2971  hypothetical protein  42.26 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0837485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3276  hypothetical protein  44.44 
 
 		 311 aa  248  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1314  hypothetical protein  41.91 
 
 		 304 aa  245  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3110  hypothetical protein  47.26 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1572  hypothetical protein  48.29 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2340  hypothetical protein  36.57 
 
 		 332 aa  211  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>