19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1266 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1266  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  782    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000946938  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_1134  hypothetical protein  56.57 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00523215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4645  hypothetical protein  51.36 
 
 		 305 aa  209  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4138  hypothetical protein  54.87 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0696829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4342  hypothetical protein  54.87 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000285606  normal  0.664167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4023  hypothetical protein  56.45 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3815  hypothetical protein  56.45 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0566843  normal  0.0130878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3906  hypothetical protein  56.45 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00507994  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4210  hypothetical protein  54.36 
 
 		 322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00115233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3850  hypothetical protein  46.86 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2931  hypothetical protein  62.59 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3244  hypothetical protein  58.6 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000400233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3378  hypothetical protein  54.6 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2693  hypothetical protein  53.8 
 
 		 317 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000346005  normal  0.196908 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1386  hypothetical protein  45.45 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3301  hypothetical protein  51.5 
 
 		 285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1882  hypothetical protein  39.15 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10609  normal  0.0787633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1032  hypothetical protein  35.42 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01584  hypothetical protein  33.53 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>