222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1245 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4592  malate synthase  68.66 
 
 		 534 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03886  malate synthase  68.84 
 
 		 533 aa  765    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.836126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5484  malate synthase  69.03 
 
 		 533 aa  766    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3983  malate synthase A  69.03 
 
 		 533 aa  766    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1483  malate synthase  79.08 
 
 		 549 aa  909    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4508  malate synthase  68.84 
 
 		 533 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03846  hypothetical protein  68.84 
 
 		 533 aa  765    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3958  malate synthase  69.19 
 
 		 532 aa  752    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2439  malate synthase  67.86 
 
 		 534 aa  743    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4516  malate synthase  68.66 
 
 		 534 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.070236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1414  malate synthase  76.06 
 
 		 572 aa  877    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0160844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1245  malate synthase  100 
 
 		 555 aa  1153    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000965788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4394  malate synthase  68.28 
 
 		 534 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4429  malate synthase  68.66 
 
 		 534 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2767  malate synthase  78.69 
 
 		 549 aa  911    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2845  malate synthase  79.05 
 
 		 549 aa  916    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0745518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0364  malate synthase  70.8 
 
 		 532 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1101  malate synthase  82.34 
 
 		 550 aa  958    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4016  malate synthase  69.03 
 
 		 533 aa  766    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.931285  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4556  malate synthase  69.22 
 
 		 533 aa  768    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3779  malate synthase  69.96 
 
 		 532 aa  761    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004372  malate synthase  68.26 
 
 		 542 aa  763    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4468  malate synthase  69.22 
 
 		 533 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.554471  normal  0.0868855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2943  malate synthase  79.42 
 
 		 549 aa  920    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0164424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01041  malate synthase  68.07 
 
 		 544 aa  743    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2381  malate synthase  80 
 
 		 543 aa  889    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.653743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0365  malate synthase A  69.13 
 
 		 532 aa  755    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3043  malate synthase  79.23 
 
 		 549 aa  913    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0450  malate synthase A  69.96 
 
 		 532 aa  760    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1316  malate synthase  79.05 
 
 		 549 aa  910    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.304553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1275  malate synthase  78.96 
 
 		 544 aa  884    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.412232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1343  malate synthase  79.05 
 
 		 549 aa  911    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0294  malate synthase  70.8 
 
 		 532 aa  771    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228257  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0218  malate synthase  69.66 
 
 		 533 aa  773    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0481486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1238  malate synthase  80.59 
 
 		 575 aa  918    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4248  malate synthase  69.03 
 
 		 533 aa  766    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0266  malate synthase  67.94 
 
 		 556 aa  754    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00405334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4519  malate synthase  68.66 
 
 		 534 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.492257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4503  malate synthase  72.04 
 
 		 532 aa  775    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1290  malate synthase  72.74 
 
 		 554 aa  842    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0639  malate synthase  70.8 
 
 		 532 aa  771    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.840399  normal  0.050441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1307  malate synthase  79.05 
 
 		 549 aa  912    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00243149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2550  malate synthase A  58 
 
 		 526 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0593  malate synthase  55.76 
 
 		 541 aa  600  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2530  malate synthase A  56.7 
 
 		 534 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3097  malate synthase A  53.67 
 
 		 1111 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.476348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2963  malate synthase  53.57 
 
 		 1110 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0853  malate synthase  53.3 
 
 		 529 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1228  malate synthase  53.48 
 
 		 529 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0718898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3198  malate synthase A  53.3 
 
 		 1111 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3782  malate synthase  55.11 
 
 		 532 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.153357  normal  0.0512216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1032  malate synthase  53.86 
 
 		 529 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.160729  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2616  malate synthase  52.72 
 
 		 522 aa  566  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1528  malate synthase  64.1 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.339488  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1209  malate synthase  52.92 
 
 		 529 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.779127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1051  malate synthase  52.92 
 
 		 529 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1026  malate synthase  52.92 
 
 		 529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1286  malate synthase  53.48 
 
 		 529 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000534021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1131  malate synthase  52.92 
 
 		 529 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00452422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4158  malate synthase  52.92 
 
 		 529 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0616937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1181  malate synthase  52.92 
 
 		 529 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2998  isocitrate lyase  53.67 
 
 		 1111 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1029  malate synthase  53.11 
 
 		 529 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.10223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2064  malate synthase  49.62 
 
 		 536 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1624  malate synthase  50.56 
 
 		 547 aa  536  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0293599  normal  0.51514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4165  malate synthase  48.67 
 
 		 523 aa  527  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.975172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12308  malate synthase  49.71 
 
 		 532 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1738  malate synthase  49.32 
 
 		 540 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1225  malate synthase  50.94 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.205342 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1590  malate synthase  50.76 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00584692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2617  malate synthase  50.76 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0627283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5361  malate synthase  50.57 
 
 		 530 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0199244  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3270  malate synthase A  49.25 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00067765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2084  malate synthase  50.75 
 
 		 530 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0850479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1016  malate synthase  51.24 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1364  malate synthase  49.62 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1954  malate synthase  50.75 
 
 		 530 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00549462  normal  0.794908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4376  malate synthase  48.39 
 
 		 523 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2092  malate synthase  50.76 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3220  malate synthase  50.76 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2475  malate synthase  50.76 
 
 		 530 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00662062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2528  malate synthase  50.76 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2071  malate synthase  50.75 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13618  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1994  malate synthase  50.38 
 
 		 530 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00500782  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6025  malate synthase  50.57 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.144445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2052  malate synthase  50.57 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179261  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2526  malate synthase A  48.3 
 
 		 524 aa  509  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000262788  normal  0.131578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1647  malate synthase  49.43 
 
 		 536 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0171397  normal  0.031328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1433  malate synthase A  48.77 
 
 		 521 aa  508  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2490  malate synthase  48.61 
 
 		 536 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0199429  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6437  malate synthase A  48.63 
 
 		 543 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2163  malate synthase A  48.96 
 
 		 528 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.96116  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06653  Malate synthase, glyoxysomal (EC 2.3.3.9) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28344]  49.72 
 
 		 539 aa  503  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.213946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0683  malate synthase A  49.15 
 
 		 534 aa  502  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1951  malate synthase  48.68 
 
 		 528 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937634  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53620  Malate synthase, glyoxysomal (MASY)  48.22 
 
 		 551 aa  499  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1372  malate synthase  48.3 
 
 		 530 aa  495  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0248  malate synthase A  49.14 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4055  malate synthase A  50 
 
 		 538 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1363  malate synthase  48.87 
 
 		 529 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>