173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1240 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 145 aa  301  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  81.25 
 
 		 144 aa  251  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  76.76 
 
 		 143 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  75.86 
 
 		 145 aa  233  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  75.86 
 
 		 145 aa  233  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  75.86 
 
 		 145 aa  233  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  75.17 
 
 		 145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  76.06 
 
 		 143 aa  229  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  74.48 
 
 		 145 aa  228  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  73.79 
 
 		 145 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  73.79 
 
 		 145 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  71.72 
 
 		 145 aa  227  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  73.79 
 
 		 145 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  73.79 
 
 		 145 aa  227  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  73.24 
 
 		 143 aa  226  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  70.42 
 
 		 144 aa  220  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  66.43 
 
 		 144 aa  203  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  64.14 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  64.14 
 
 		 158 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  64.14 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  64.14 
 
 		 158 aa  196  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  64.14 
 
 		 158 aa  196  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  64.14 
 
 		 158 aa  196  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  64.14 
 
 		 158 aa  196  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  64.14 
 
 		 145 aa  196  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  65.49 
 
 		 158 aa  195  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  64.79 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  64.79 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  63.45 
 
 		 158 aa  194  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  64.79 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  64.79 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  65.49 
 
 		 148 aa  191  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  63.38 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  63.38 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  63.38 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  62.5 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  64.79 
 
 		 148 aa  190  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  63.38 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  63.38 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  61.97 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  59.86 
 
 		 147 aa  181  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  59.15 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  61.27 
 
 		 146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  54.93 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  53.15 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  50.7 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  45.14 
 
 		 175 aa  156  8e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1740  cyclase/dehydrase  50 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  48.2 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  46.48 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  47.86 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  45.71 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  47.86 
 
 		 144 aa  143  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  46.43 
 
 		 144 aa  143  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  47.45 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  45.71 
 
 		 144 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  46.72 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  45.07 
 
 		 143 aa  141  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  46.72 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  44.06 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  45.07 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  43.45 
 
 		 185 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  47.18 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3368  cyclase/dehydrase  46.15 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00867336  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  46.48 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3970  cyclase/dehydrase  44.37 
 
 		 143 aa  133  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.578911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  42.07 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  44.14 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  44.14 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  42.25 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  41.73 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  41.55 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  41.55 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  42.25 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  44.44 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  41.55 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  43.66 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  44.83 
 
 		 148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  44.9 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  42.25 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  42.96 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  42.96 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  40.85 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  41.55 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  40.85 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  40.85 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  40.85 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  40.85 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  40.85 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  42.25 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  41.55 
 
 		 145 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  39.44 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  40.85 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2626  cyclase/dehydrase  40.85 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  44.83 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1755  hypothetical protein  38.46 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>