More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1218 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  67.15 
 
 
944 aa  1349  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  67.15 
 
 
950 aa  1347  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  52.95 
 
 
945 aa  981  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  67.15 
 
 
950 aa  1347  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  68.17 
 
 
944 aa  1294  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  100 
 
 
974 aa  2018  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  67.25 
 
 
944 aa  1343  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  62.47 
 
 
945 aa  1274  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  48.92 
 
 
969 aa  887  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  65.15 
 
 
944 aa  1293  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  45.99 
 
 
952 aa  838  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  45.44 
 
 
947 aa  857  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  45.89 
 
 
947 aa  874  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  47.05 
 
 
950 aa  892  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  67.39 
 
 
949 aa  1339  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  64.29 
 
 
945 aa  1289  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  69.11 
 
 
943 aa  1370  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  50.73 
 
 
959 aa  978  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  67.15 
 
 
950 aa  1346  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  67.42 
 
 
949 aa  1339  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  50.52 
 
 
958 aa  993  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  65.36 
 
 
944 aa  1298  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  67.22 
 
 
949 aa  1338  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  67.32 
 
 
949 aa  1337  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  34.09 
 
 
954 aa  525  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  34.26 
 
 
921 aa  516  1e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  33.37 
 
 
943 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  32.36 
 
 
949 aa  467  1e-130  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  32.36 
 
 
929 aa  466  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  32.79 
 
 
947 aa  466  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  32.1 
 
 
960 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  32.17 
 
 
962 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  33.37 
 
 
930 aa  432  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  32.76 
 
 
949 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  31.27 
 
 
956 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  32.05 
 
 
967 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  31.06 
 
 
959 aa  405  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  30.76 
 
 
952 aa  400  1e-110  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  31.14 
 
 
901 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  28.56 
 
 
910 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  30.59 
 
 
903 aa  357  4e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  30.56 
 
 
904 aa  353  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  42.38 
 
 
458 aa  322  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  42.38 
 
 
458 aa  321  4e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  42.14 
 
 
458 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  27.98 
 
 
954 aa  315  2e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  26.45 
 
 
945 aa  291  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.68 
 
 
937 aa  290  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  26.38 
 
 
929 aa  288  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.49 
 
 
896 aa  286  1e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  27.44 
 
 
918 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  34.53 
 
 
440 aa  265  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  37.41 
 
 
470 aa  264  5e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  25.51 
 
 
876 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  37.85 
 
 
429 aa  251  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  33.57 
 
 
422 aa  244  4e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  25.87 
 
 
934 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  32.94 
 
 
440 aa  242  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  36.68 
 
 
429 aa  241  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  38.26 
 
 
423 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  35.31 
 
 
447 aa  234  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  33.49 
 
 
442 aa  233  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  33.49 
 
 
470 aa  226  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  31.83 
 
 
453 aa  221  7e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  25.45 
 
 
949 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  35.81 
 
 
464 aa  214  4e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.06 
 
 
452 aa  214  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  32.93 
 
 
443 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  36.57 
 
 
461 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  36.29 
 
 
461 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 
443 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 
443 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  35.71 
 
 
464 aa  212  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  31.58 
 
 
453 aa  211  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  32.93 
 
 
443 aa  211  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  25.53 
 
 
919 aa  210  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  33.33 
 
 
411 aa  210  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  32.93 
 
 
443 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 
482 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  35.01 
 
 
476 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  33.01 
 
 
427 aa  209  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  32.93 
 
 
443 aa  209  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  32.93 
 
 
443 aa  207  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  32.06 
 
 
428 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  33.09 
 
 
443 aa  207  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  32.68 
 
 
443 aa  207  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  27.4 
 
 
948 aa  206  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  35.87 
 
 
489 aa  207  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  32.93 
 
 
443 aa  206  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  34.94 
 
 
469 aa  205  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  32.68 
 
 
461 aa  205  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  31.41 
 
 
465 aa  205  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  32.78 
 
 
448 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  24.51 
 
 
912 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  32.27 
 
 
442 aa  204  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  31.5 
 
 
443 aa  204  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.13625e-07  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  32.94 
 
 
443 aa  204  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  29.98 
 
 
457 aa  204  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  31.63 
 
 
530 aa  204  1e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  29.98 
 
 
441 aa  202  2e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>