More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1207 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  56.21 
 
 
857 aa  966  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  6.09956e-10 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.85 
 
 
881 aa  667  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  77.82 
 
 
859 aa  1381  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  63.91 
 
 
851 aa  1120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  77.56 
 
 
859 aa  1373  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  4.08163e-09 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  64.71 
 
 
860 aa  1097  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  64.3 
 
 
853 aa  1094  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  64.95 
 
 
853 aa  1127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  57.91 
 
 
871 aa  1014  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  64.44 
 
 
851 aa  1128  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  81.28 
 
 
856 aa  1434  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
928 aa  645  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  81.28 
 
 
856 aa  1432  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  64.3 
 
 
853 aa  1097  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  64.3 
 
 
853 aa  1094  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  64.21 
 
 
851 aa  1125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  55.87 
 
 
880 aa  959  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
867 aa  664  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  64.44 
 
 
851 aa  1128  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  57.67 
 
 
859 aa  1008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  51.08 
 
 
884 aa  814  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  47.11 
 
 
911 aa  741  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 
932 aa  676  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  57.64 
 
 
855 aa  993  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  53.93 
 
 
883 aa  942  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  5.82755e-10 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  56 
 
 
857 aa  962  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  47.38 
 
 
871 aa  728  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  50.92 
 
 
939 aa  829  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  49.88 
 
 
870 aa  755  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  46.39 
 
 
890 aa  705  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  57.73 
 
 
874 aa  1038  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  64.34 
 
 
856 aa  1138  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  75.67 
 
 
854 aa  1347  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  41.19 
 
 
872 aa  641  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 
870 aa  660  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  80.65 
 
 
861 aa  1434  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  55.23 
 
 
868 aa  902  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  48.57 
 
 
870 aa  738  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  65.27 
 
 
862 aa  1129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  81.28 
 
 
856 aa  1430  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  64.26 
 
 
853 aa  1108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  76.25 
 
 
855 aa  1366  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  50.92 
 
 
939 aa  829  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  50.92 
 
 
939 aa  829  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  50.69 
 
 
891 aa  825  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  80.93 
 
 
856 aa  1425  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 
870 aa  684  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  50.92 
 
 
939 aa  829  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  46.29 
 
 
868 aa  740  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.77149e-05  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  76.8 
 
 
858 aa  1355  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  4.11572e-08 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  46.59 
 
 
891 aa  724  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  56.96 
 
 
855 aa  965  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1076  DNA mismatch repair protein MutS  47.67 
 
 
884 aa  739  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  57.75 
 
 
862 aa  944  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 
896 aa  697  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 
873 aa  660  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 
850 aa  644  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  47.96 
 
 
870 aa  710  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  81.28 
 
 
856 aa  1432  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  8.30859e-12 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  49.94 
 
 
897 aa  832  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 
853 aa  644  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3589  DNA mismatch repair protein MutS  47.69 
 
 
885 aa  730  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1089  DNA mismatch repair protein MutS  52.08 
 
 
882 aa  835  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  50.4 
 
 
897 aa  811  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 
862 aa  641  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  65.33 
 
 
853 aa  1129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  49.89 
 
 
881 aa  816  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  64.42 
 
 
854 aa  1124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 
897 aa  655  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  64.19 
 
 
854 aa  1120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  64.75 
 
 
852 aa  1117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02548  hypothetical protein  64.3 
 
 
853 aa  1094  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.766489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  64.69 
 
 
854 aa  1122  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 
869 aa  667  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3986  DNA mismatch repair protein MutS  64.42 
 
 
853 aa  1098  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.724345  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  65.1 
 
 
855 aa  1127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 
869 aa  685  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  3.95311e-05 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01536  DNA mismatch repair protein MutS  53.98 
 
 
851 aa  894  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0993  DNA mismatch repair protein MutS  51.95 
 
 
882 aa  828  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0273389  normal  0.417331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2520  DNA mismatch repair protein MutS  49.61 
 
 
894 aa  795  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00821283  hitchhiker  3.91787e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  64.19 
 
 
853 aa  1092  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1399  DNA mismatch repair protein MutS  50.9 
 
 
892 aa  790  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  4.34224e-05 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  52.85 
 
 
858 aa  895  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  51.93 
 
 
885 aa  837  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.68418e-06 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1181  DNA mismatch repair protein MutS  47.54 
 
 
886 aa  720  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1238  DNA mismatch repair protein MutS  53.31 
 
 
858 aa  879  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 
871 aa  649  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
872 aa  661  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  47.96 
 
 
870 aa  710  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  64.83 
 
 
855 aa  1110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  64.83 
 
 
855 aa  1111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  61.69 
 
 
863 aa  1066  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  64.71 
 
 
855 aa  1110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  64.83 
 
 
855 aa  1111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  64.95 
 
 
855 aa  1115  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  52.97 
 
 
863 aa  897  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 
872 aa  654  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 
875 aa  667  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2107  DNA mismatch repair protein MutS  51.36 
 
 
885 aa  810  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.069343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  50.8 
 
 
893 aa  833  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>