26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1186 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  55.74 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 112 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  62.96 
 
 		 137 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  52.38 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 136 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  46.27 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  35.54 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  42.25 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 137 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 91 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  44.83 
 
 		 95 aa  41.6  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>