More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1183 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  91.56 
 
 
377 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  91.01 
 
 
376 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  91.56 
 
 
377 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  89.21 
 
 
378 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  88.89 
 
 
376 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  91.56 
 
 
377 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  90.74 
 
 
376 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  88.13 
 
 
378 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  87.6 
 
 
378 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1183  chaperone protein DnaJ  100 
 
 
377 aa  764    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000246856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  91.29 
 
 
377 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  91.53 
 
 
376 aa  656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  91.03 
 
 
377 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  91.03 
 
 
377 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.406882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  92.86 
 
 
376 aa  673    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  90.5 
 
 
377 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  74.02 
 
 
379 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  74.02 
 
 
379 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  74.02 
 
 
379 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  75.2 
 
 
379 aa  564  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0383  chaperone protein DnaJ  76.18 
 
 
381 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  76.52 
 
 
389 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  72.18 
 
 
379 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  72.18 
 
 
379 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  72.18 
 
 
379 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  72.18 
 
 
379 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  72.18 
 
 
379 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  71.69 
 
 
376 aa  551  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  71.96 
 
 
376 aa  551  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  71.96 
 
 
376 aa  551  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  71.65 
 
 
378 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  71.96 
 
 
376 aa  551  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  71.39 
 
 
378 aa  551  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  71.69 
 
 
376 aa  551  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  72.63 
 
 
377 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  71.96 
 
 
376 aa  551  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  71.69 
 
 
376 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  71.69 
 
 
376 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  70.57 
 
 
382 aa  548  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  72.37 
 
 
377 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  72.3 
 
 
375 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  71.69 
 
 
376 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2470  chaperone protein DnaJ  73.42 
 
 
380 aa  548  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  74.93 
 
 
382 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  75.13 
 
 
381 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  68.62 
 
 
372 aa  531  1e-150  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0918  chaperone protein DnaJ  68.68 
 
 
377 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.343225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  69.31 
 
 
375 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  69.76 
 
 
374 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  69.23 
 
 
374 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  69.5 
 
 
374 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  67.2 
 
 
375 aa  502  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  68.25 
 
 
375 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3820  chaperone protein DnaJ  67.37 
 
 
378 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  68.44 
 
 
397 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  65.09 
 
 
381 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  66.84 
 
 
377 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  66.05 
 
 
377 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  66.84 
 
 
380 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0973  chaperone protein DnaJ  65.6 
 
 
377 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  67.89 
 
 
380 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  62.03 
 
 
377 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  61.74 
 
 
379 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  61.74 
 
 
379 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  62.57 
 
 
374 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3361  chaperone protein DnaJ  65.43 
 
 
374 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151638  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  61.6 
 
 
375 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  63.9 
 
 
372 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2732  chaperone protein DnaJ  64.63 
 
 
374 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000152871  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  61.07 
 
 
374 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1601  chaperone protein DnaJ  61.9 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.095683  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3963  chaperone protein DnaJ  64.1 
 
 
374 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  58.12 
 
 
380 aa  454  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2810  heat shock protein DnaJ  62.47 
 
 
380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00638264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1855  dnaJ protein  63.49 
 
 
377 aa  448  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  56.58 
 
 
380 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  59.47 
 
 
373 aa  448  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  59.26 
 
 
373 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  58.62 
 
 
368 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  58.36 
 
 
368 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  56.32 
 
 
378 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3309  chaperone protein DnaJ  56.88 
 
 
376 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  56.88 
 
 
376 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  58.95 
 
 
378 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3320  chaperone protein DnaJ  56.88 
 
 
376 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  56.58 
 
 
378 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  56.32 
 
 
378 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  62.4 
 
 
383 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  56.58 
 
 
378 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01186  chaperone protein DnaJ  60.95 
 
 
376 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12513  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  56.32 
 
 
378 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  56.08 
 
 
376 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  56.61 
 
 
376 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  57.82 
 
 
378 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3840  chaperone protein DnaJ  55.79 
 
 
378 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.448358  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  56.61 
 
 
376 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3219  chaperone protein DnaJ  59.68 
 
 
376 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  55.53 
 
 
379 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  55.91 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  56.61 
 
 
376 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>