More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1173 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  100 
 
 
458 aa  947    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  35.08 
 
 
507 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  33.67 
 
 
508 aa  282  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  33.67 
 
 
512 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  32.51 
 
 
519 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  32.65 
 
 
519 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  32.87 
 
 
514 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  28.63 
 
 
518 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.06 
 
 
549 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  28.6 
 
 
554 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  28.48 
 
 
536 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  28.63 
 
 
523 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  27.98 
 
 
497 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  26.79 
 
 
572 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  28.57 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  27.96 
 
 
509 aa  167  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  28.03 
 
 
481 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  28.07 
 
 
496 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.73 
 
 
537 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  26.78 
 
 
513 aa  156  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  25.93 
 
 
494 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  25.81 
 
 
518 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  25.05 
 
 
503 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  26.95 
 
 
486 aa  144  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  27.7 
 
 
505 aa  143  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  24.57 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  24.57 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  24.57 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  24.57 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  24.57 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  24.57 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  26.11 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  27.27 
 
 
447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  24.73 
 
 
503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  24.94 
 
 
496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  24.78 
 
 
517 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  25.18 
 
 
526 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  24.46 
 
 
517 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  26.15 
 
 
482 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  24.41 
 
 
502 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  26.36 
 
 
535 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  26.84 
 
 
489 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  24.62 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  25.38 
 
 
502 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  24.25 
 
 
515 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  28.6 
 
 
473 aa  137  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  26 
 
 
511 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  23.21 
 
 
510 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  26.08 
 
 
501 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  25.62 
 
 
502 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  25 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  25.05 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  26.08 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  25 
 
 
504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  25 
 
 
512 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  25 
 
 
516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  25 
 
 
516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  24.73 
 
 
520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  24.06 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  24.01 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  23.84 
 
 
501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  26 
 
 
482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  23.53 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  24.22 
 
 
504 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25.77 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.38 
 
 
499 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  25.91 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47845  predicted protein  26.86 
 
 
620 aa  130  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0593792  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  23.85 
 
 
503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  25.11 
 
 
497 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  25.33 
 
 
511 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  23.71 
 
 
505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  23.71 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  24.25 
 
 
498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  25.43 
 
 
501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  24.95 
 
 
559 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  24.36 
 
 
516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  25.44 
 
 
564 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  24.78 
 
 
489 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  25.05 
 
 
485 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  25.85 
 
 
511 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  25.64 
 
 
517 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  26.71 
 
 
480 aa  123  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1101  sulfatase family protein  23.39 
 
 
487 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00123552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  24.68 
 
 
478 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  24.46 
 
 
511 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  23.08 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  25.86 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  23.82 
 
 
594 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  24.74 
 
 
506 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  24.89 
 
 
493 aa  113  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  21.73 
 
 
526 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  24.2 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  24.57 
 
 
481 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  24.07 
 
 
549 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  23.97 
 
 
586 aa  110  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  26.72 
 
 
481 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  24.6 
 
 
511 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  24.29 
 
 
495 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  25.33 
 
 
784 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>