More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1161 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  100 
 
 		 545 aa  1123    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  48.14 
 
 		 562 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.3 
 
 		 561 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.3 
 
 		 561 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  47.49 
 
 		 561 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.78 
 
 		 562 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.3 
 
 		 561 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.11 
 
 		 561 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.21 
 
 		 562 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  46.58 
 
 		 578 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  47.47 
 
 		 564 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  48.14 
 
 		 562 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  48.14 
 
 		 562 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  46.47 
 
 		 568 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  48.14 
 
 		 562 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.96 
 
 		 562 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.16 
 
 		 556 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.96 
 
 		 562 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.96 
 
 		 562 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.2 
 
 		 581 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  47.96 
 
 		 562 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0628  PEP phosphomutase  56.25 
 
 		 300 aa  353  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3412  PEP phosphonomutase protein  55.94 
 
 		 328 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2167  phosphoenolpyruvate phosphomutase  54.9 
 
 		 297 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3871  phosphoenolpyruvate phosphomutase  49.65 
 
 		 319 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0160  putative phosphoenolpyruvate phosphomutase  42.07 
 
 		 299 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000192522 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3887  phosphonopyruvate hydrolase  38.41 
 
 		 290 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.730793  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1413  cytidylyltransferase/phosphoenolpyruvate phosphomutase, putative  35.42 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5665  phosphoenolpyruvate phosphomutase  35.34 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0818  putative hydrolase  35.4 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.668658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0910  putative hydrolase  35.4 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489076  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  29.63 
 
 		 306 aa  144  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0572  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.47 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0476  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.47 
 
 		 310 aa  141  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.04 
 
 		 289 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  29.41 
 
 		 311 aa  139  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  28.72 
 
 		 304 aa  135  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  31.85 
 
 		 312 aa  133  9e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.98 
 
 		 288 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1956  phosphoenolpyruvate phosphomutase  34.6 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.296795  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  28.87 
 
 		 301 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  30.59 
 
 		 306 aa  124  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  30.45 
 
 		 294 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  28.57 
 
 		 295 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  29.51 
 
 		 286 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  29.1 
 
 		 295 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  30.22 
 
 		 293 aa  120  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.22 
 
 		 293 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  30.8 
 
 		 293 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  28.1 
 
 		 304 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  30.04 
 
 		 282 aa  118  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  36.84 
 
 		 291 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5166  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  29.29 
 
 		 292 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.919323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  28.32 
 
 		 308 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  28.47 
 
 		 287 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  27.08 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  29.48 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  28.52 
 
 		 284 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12030  methylisocitrate lyase  29.07 
 
 		 312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.55917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1916  isocitrate lyase family protein  27.3 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0326533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  29.1 
 
 		 287 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  28.52 
 
 		 284 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  30.62 
 
 		 302 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  28.52 
 
 		 284 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  30.12 
 
 		 285 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  29.1 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1587  2-methylisocitrate lyase  31.2 
 
 		 302 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000235696  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  29.51 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  30.58 
 
 		 287 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  29.23 
 
 		 284 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  30.17 
 
 		 287 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  28.95 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  33.51 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0141  2-methylisocitrate lyase  29.85 
 
 		 297 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.758126  normal  0.590891 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3861  2-methylisocitrate lyase  29.96 
 
 		 298 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3975  2-methylisocitrate lyase  29.96 
 
 		 298 aa  109  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.583072 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  28.67 
 
 		 288 aa  109  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5517  2-methylisocitrate lyase  30.22 
 
 		 297 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  27.99 
 
 		 289 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  29.84 
 
 		 289 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4755  2-methylisocitrate lyase  30.22 
 
 		 297 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.730915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  26.64 
 
 		 286 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5344  2-methylisocitrate lyase  30.22 
 
 		 297 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3287  2-methylisocitrate lyase  30.6 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179718  normal  0.0341449 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  27.57 
 
 		 310 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  26.3 
 
 		 286 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  27.13 
 
 		 263 aa  107  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1764  2-methylisocitrate lyase  31.58 
 
 		 296 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0054  2-methylisocitrate lyase  28.2 
 
 		 297 aa  107  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  29.72 
 
 		 274 aa  106  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1509  2-methylisocitrate lyase  30.14 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.265222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2085  2-methylisocitrate lyase  30.48 
 
 		 297 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.36601  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2209  2-methylisocitrate lyase  30.3 
 
 		 294 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.629465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0204  2,3-dimethylmalate lyase  30.45 
 
 		 325 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  29.45 
 
 		 295 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  29.55 
 
 		 296 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0052  2-methylisocitrate lyase  27.87 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3436  2-methylisocitrate lyase  32.22 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00574123  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2334  2-methylisocitrate lyase  31.85 
 
 		 296 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474392  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3030  2-methylisocitrate lyase  29.79 
 
 		 297 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>