42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0989 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000803888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2532  hypothetical protein  78.38 
 
 		 74 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.555967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3096  hypothetical protein  79.73 
 
 		 73 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0947  hypothetical protein  83.78 
 
 		 74 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0943  hypothetical protein  83.78 
 
 		 74 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0981  hypothetical protein  83.78 
 
 		 74 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.294552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0945  hypothetical protein  83.78 
 
 		 74 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1110  hypothetical protein  82.43 
 
 		 74 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3431  hypothetical protein  81.08 
 
 		 74 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0177543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3359  protein of unknown function DUF539  81.08 
 
 		 74 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00348618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3556  hypothetical protein  81.08 
 
 		 74 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0931  hypothetical protein  81.08 
 
 		 74 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.977119  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0956  hypothetical protein  85.14 
 
 		 74 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0537331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3610  hypothetical protein  79.73 
 
 		 74 aa  104  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2874  hypothetical protein  79.73 
 
 		 74 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3424  hypothetical protein  77.03 
 
 		 73 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00752  uncharacterized conserved membrane  58.44 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0459  hypothetical protein  60.29 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3298  hypothetical protein  52.7 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3310  hypothetical protein  52.7 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0946047  hitchhiker  0.00000513019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3159  hypothetical protein  52.7 
 
 		 75 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03268  hypothetical protein  56.58 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0960  hypothetical protein  47.3 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0956  hypothetical protein  53.95 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0753  hypothetical protein  45.95 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1685  hypothetical protein  44.44 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002714  hypothetical protein  57.69 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1877  hypothetical protein  51.92 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1087  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0940  hypothetical protein  37.7 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0322153  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000683  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2286  protein of unknown function DUF539  41.79 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0636818  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2432  hypothetical protein  41.54 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0752  hypothetical protein  32.81 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2111  hypothetical protein  41.54 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2168  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1718  hypothetical protein  36.92 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0580683  normal  0.0217138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25370  hypothetical protein  31.94 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0091  hypothetical protein  31.17 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1804  hypothetical protein  37.74 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3419  hypothetical protein  30.77 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2383  hypothetical protein  35 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>