More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0974 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  100 
 
 
205 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  60.29 
 
 
202 aa  258  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  61.5 
 
 
200 aa  255  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  61 
 
 
202 aa  254  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  61 
 
 
202 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  61.42 
 
 
201 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  61.42 
 
 
201 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  61.86 
 
 
189 aa  247  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  60.91 
 
 
201 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  59.79 
 
 
190 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 
191 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  54.15 
 
 
206 aa  228  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
190 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
193 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  56.54 
 
 
194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  53.3 
 
 
194 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 
195 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
197 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
192 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
196 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
190 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 
226 aa  62.4  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
192 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
192 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
192 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.65 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
224 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 
190 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
216 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
191 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
222 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
218 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
188 aa  58.2  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  33.33 
 
 
280 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
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