28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0969 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0969  curli production assembly/transport component CsgE, putative  100 
 
 		 136 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0868  curli production assembly/transport component CsgE, putative  69.92 
 
 		 136 aa  193  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3255  curli production assembly/transport component CsgE, putative  69.17 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3154  curli production assembly/transport component CsgE, putative  69.47 
 
 		 136 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0641  curli production assembly/transport component CsgE, putative  68.38 
 
 		 131 aa  191  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000725097  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1036  curli production assembly/transport component CsgE, putative  72.58 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.730845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1024  curli production assembly/transport component CsgE, putative  72.58 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3336  curli production assembly/transport component CsgE, putative  72.58 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1003  curli production assembly/transport component CsgE, putative  71.77 
 
 		 136 aa  189  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3687  curli production assembly/transport component CsgE, putative  66.91 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2986  curli production assembly/transport component CsgE, putative  74.77 
 
 		 136 aa  184  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2859  curli production assembly/transport component CsgE, putative  81.37 
 
 		 113 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01504  curli production assembly/transport component  32.58 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2857  assembly/transport component in curli production, CsgE precursor  36.89 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2297  curli assembly protein CsgE  28.97 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3474  curli assembly protein CsgE  28.97 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443739  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2472  curli assembly protein CsgE  28.97 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768974  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01043  hypothetical protein  29.03 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1418  curli assembly protein CsgE  29.03 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0884878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01036  predicted transport protein  29.03 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2094  curli assembly protein CsgE  29.03 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2560  curli assembly protein CsgE  29.03 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2463  curli assembly protein CsgE  28 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1158  curli assembly protein CsgE  29.03 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1157  curli assembly protein CsgE  29.03 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2606  regulator of chromosome condensation RCC1  29.03 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0218949  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2586  hypothetical protein  26.37 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1555  curli assembly protein CsgE  34.15 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.271531  normal  0.205881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>