281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0945 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  83.01 
 
 		 539 aa  862    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  82.63 
 
 		 539 aa  861    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 534 aa  1066    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  82.82 
 
 		 539 aa  862    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  83.01 
 
 		 539 aa  864    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  52.09 
 
 		 544 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  50 
 
 		 544 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  47.41 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  45.45 
 
 		 516 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  60.95 
 
 		 584 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  42.14 
 
 		 527 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  37.12 
 
 		 603 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  37.25 
 
 		 603 aa  326  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0374  amino acid/peptide transporter  34.27 
 
 		 627 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  33.53 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  33.02 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  33.66 
 
 		 492 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  33.46 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  35.17 
 
 		 497 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  34.9 
 
 		 504 aa  259  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  32.83 
 
 		 495 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  33.57 
 
 		 533 aa  256  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  34.76 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  35.12 
 
 		 497 aa  253  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  33.52 
 
 		 497 aa  250  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  35.19 
 
 		 501 aa  250  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  33.46 
 
 		 517 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  32.05 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  35.79 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  35.79 
 
 		 446 aa  239  8e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  33.05 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  32.34 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  32.22 
 
 		 512 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  32.22 
 
 		 512 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  32.23 
 
 		 528 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  33.54 
 
 		 483 aa  233  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  29.5 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  31.11 
 
 		 507 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  32.64 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  32.14 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  32.64 
 
 		 510 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  30.8 
 
 		 501 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  30.8 
 
 		 501 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  28.92 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  33.97 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  31.11 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  33.81 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  33.27 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  31.28 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  32.52 
 
 		 499 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  33.03 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  31.03 
 
 		 493 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  31.03 
 
 		 493 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  31.03 
 
 		 493 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  31.03 
 
 		 493 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  31.04 
 
 		 461 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  31.04 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  31.04 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  31.04 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  32.16 
 
 		 500 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  30.88 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  31.04 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  31.04 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  30.88 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  30.83 
 
 		 493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  31.1 
 
 		 558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  31.19 
 
 		 517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  35.18 
 
 		 477 aa  216  5.9999999999999996e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  29.41 
 
 		 493 aa  216  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  29.41 
 
 		 493 aa  216  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  30.89 
 
 		 520 aa  216  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  31.38 
 
 		 498 aa  216  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  29.41 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  28.25 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  29.41 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  27.34 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  29.21 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  29.21 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  32.89 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  27.43 
 
 		 506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  29.21 
 
 		 493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  32.52 
 
 		 482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  31.43 
 
 		 516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  29.21 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  30.76 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  29.01 
 
 		 493 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  30.11 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  30.57 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  27.78 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  27.78 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  27.78 
 
 		 501 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  27.18 
 
 		 500 aa  210  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  27.78 
 
 		 501 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  27.78 
 
 		 501 aa  210  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  28.49 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  27.47 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  27.47 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  27.47 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  27.47 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  30.33 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>