More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0784 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  58.33 
 
 		 288 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  58.33 
 
 		 290 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  57.94 
 
 		 288 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  57.94 
 
 		 274 aa  298  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  57.94 
 
 		 268 aa  298  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  58.33 
 
 		 272 aa  297  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  57.71 
 
 		 254 aa  297  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  57.54 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  57.14 
 
 		 272 aa  295  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  47.92 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  49.14 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  46.22 
 
 		 260 aa  217  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  50 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  43.03 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  44.88 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  43.7 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  42.91 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  44.88 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  40.42 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  40.42 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  42.13 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  40 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  39.23 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  45.04 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  41.38 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  42.52 
 
 		 266 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  42.52 
 
 		 266 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  42.52 
 
 		 266 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  43.98 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  37.5 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  40.3 
 
 		 293 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  41.8 
 
 		 284 aa  175  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.36 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  36.72 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  43.93 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  38.61 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  41.92 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  38.83 
 
 		 272 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  41.42 
 
 		 265 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  40.48 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  38.61 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  37.77 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  38.52 
 
 		 282 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  44.3 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  37.45 
 
 		 268 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  41.08 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0998  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.93 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3462  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.93 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  36.9 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  37.74 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  37.18 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3333  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  38.27 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  37.3 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  41.5 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  36.46 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  36.46 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  36.46 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0156  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3451  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0148611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0209  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  37.21 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  39.3 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0225  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0221  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  39.58 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3769  ABC transporter related  36.82 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187611 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  34.63 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  42.08 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00150  iron-hydroxamate transporter subunit  40.08 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00128613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0163  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0161  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  37.6 
 
 		 266 aa  164  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  40.08 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0210  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  40.32 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.27 
 
 		 418 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0228  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  32.43 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  40.17 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>