More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0718 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 160 aa  319  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 160 aa  264  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  82.17 
 
 		 158 aa  259  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  82.17 
 
 		 158 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  82.17 
 
 		 158 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  82.17 
 
 		 158 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  80.25 
 
 		 161 aa  259  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  81.53 
 
 		 158 aa  258  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  80.25 
 
 		 165 aa  258  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  80.25 
 
 		 165 aa  258  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  79.62 
 
 		 158 aa  256  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  78.98 
 
 		 157 aa  256  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  78.34 
 
 		 157 aa  254  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 158 aa  247  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  75.95 
 
 		 161 aa  235  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2736  MarR family transcriptional regulator  74.52 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000198775  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  57.72 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  55.03 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  57.05 
 
 		 167 aa  178  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 174 aa  177  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4007  MarR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 148 aa  170  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.177253  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 173 aa  150  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 167 aa  150  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  44.14 
 
 		 191 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  46 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  45.07 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  40.74 
 
 		 135 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  37.18 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  36.3 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 177 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2954  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0252271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  34.07 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  26.76 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  39.29 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1910  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0578168  normal  0.331204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0726  regulatory protein MarR  31.96 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0710  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0342  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  34.67 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3980  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436486  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  33.67 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  32.41 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  31.67 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>