50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0677 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0677  penicillinase repressor  100 
 
 		 133 aa  274  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2142  CopY family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.325229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  30.25 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  30.77 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  28.21 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0359  CopY family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.666305 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  24.11 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  30.51 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  37.5 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  22.94 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  27.83 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1264  transcriptional repressor CopY, putative  25 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.352624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2754  transcriptional repressor, CopY family  36.14 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  29.17 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3223  transcriptional repressor, CopY family  27.27 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0560  transcriptional repressor, CopY family  23.21 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  28 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  31.45 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1547  negative transcriptional regulator - copper transport operon  31.88 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  30.65 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  27.42 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  26.72 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  28.12 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  26.09 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  31.45 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  31.45 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  28.12 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  30.65 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  26.79 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3586  putative penicillinase repressor, transcriptional regulatory protein  34.43 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1935  transcriptional repressor, CopY family  24.56 
 
 		 122 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  24.14 
 
 		 130 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2324  CopY family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 119 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  29 
 
 		 139 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1301  transcriptional repressor, CopY family  25.23 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0225104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  18.97 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  18.97 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  18.97 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  24.47 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1873  transcriptional regulator  19.67 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171303  hitchhiker  0.00000000171103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>