More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0670 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  735    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  71.08 
 
 		 370 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  44.85 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  42.71 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  38.67 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  39.04 
 
 		 375 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  40.38 
 
 		 381 aa  235  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  40.43 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  38.02 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  35.56 
 
 		 375 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  42.57 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  36.97 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1711  hypothetical protein  37.82 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000795041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3498  hypothetical protein  36.41 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1228  protein of unknown function DUF140  36.39 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  37.5 
 
 		 372 aa  203  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  33.9 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  35.15 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  37.75 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  35.96 
 
 		 386 aa  189  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  30.91 
 
 		 370 aa  186  7e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  38.03 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  31.67 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  31.38 
 
 		 369 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  39 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  33.44 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  31.09 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  33.13 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  31.56 
 
 		 366 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  32.83 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  33.73 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  31.49 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  33.06 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  30.26 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  28.8 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  38.33 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  30.96 
 
 		 370 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  33.68 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  29.82 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  37.6 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  30.25 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  30.03 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  30.47 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  29.48 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  30.08 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  31.64 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  33 
 
 		 383 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  30.45 
 
 		 373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  29.48 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  35.61 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  35.8 
 
 		 375 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  29.72 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  31.72 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  31.37 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  36.99 
 
 		 382 aa  159  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  30.91 
 
 		 374 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  34.07 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  30.27 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  27.79 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  35.4 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  34.39 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  29.01 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  32.87 
 
 		 379 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  32.41 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  31.74 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  32.41 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  29.05 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  29.44 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  31.62 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  30.36 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  29.92 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  30.41 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  32.44 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  41.23 
 
 		 250 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  34.74 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  33.83 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  28.07 
 
 		 377 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  30.25 
 
 		 382 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  29.75 
 
 		 383 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  30.99 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  31.61 
 
 		 376 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  29.86 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  36.04 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  32.8 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  28.41 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  38.16 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  28.57 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  29.97 
 
 		 368 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  33.88 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  35.59 
 
 		 383 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  34.84 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  35.05 
 
 		 447 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  34.58 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0174  ABC transporter, permease protein, putative  34.16 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  35.05 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  34.58 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  26.52 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  32.61 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  34.58 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>