36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0665 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  339  8e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  25.9 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  30.56 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  27.22 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  25.35 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3632  hypothetical protein  28.22 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  26.03 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  23.13 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  26.62 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  24.48 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  22.81 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  26.74 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  24.52 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  30.66 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  24.22 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  22.29 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  24.14 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  21.82 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02456  hypothetical protein  24.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3842  hypothetical protein  24.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00682027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2990  hypothetical protein  24.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2887  hypothetical protein  24.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0165509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1080  hypothetical protein  24.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.072427  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02492  hypothetical protein  24.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.428516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2762  hypothetical protein  24.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655824  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1071  conserved hypothetical protein  24.43 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0222313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  25.81 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  25.81 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  27.54 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  21.95 
 
 		 220 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  27.54 
 
 		 190 aa  44.7  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  24.82 
 
 		 235 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  25.18 
 
 		 235 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2755  hypothetical protein  24.43 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.180367  normal  0.0107681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2885  hypothetical protein  23.66 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00516229  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>