More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0456 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0456  Sec-independent protein translocase TatC  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3900  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  83.27 
 
 		 251 aa  430  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0414  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  83.27 
 
 		 251 aa  430  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0426  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  83.27 
 
 		 251 aa  430  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3556  Sec-independent protein translocase TatC  85.54 
 
 		 249 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0400  Sec-independent protein translocase TatC  85.94 
 
 		 249 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4204  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  83.87 
 
 		 249 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0440  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  83.27 
 
 		 251 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.289196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0501  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  83.94 
 
 		 249 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0470  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  82.59 
 
 		 248 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4101  sec-independent protein translocase, TatC subunit  85.04 
 
 		 255 aa  410  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.84957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3797  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  86.02 
 
 		 253 aa  413  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3378  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  81.05 
 
 		 251 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3730  Sec-independent protein translocase TatC  82.56 
 
 		 249 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3207  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  80.89 
 
 		 250 aa  381  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0522  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  83.83 
 
 		 256 aa  362  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00567  Sec-independent protein translocase protein  65.59 
 
 		 249 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00562  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  67.07 
 
 		 251 aa  352  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3001  sec-independent protein translocase protein TatC  67.34 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4215  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.39 
 
 		 269 aa  343  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4183  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.11 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.335663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4362  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.11 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4255  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.11 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4206  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.11 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4302  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  61.11 
 
 		 259 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.901815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2427  hypothetical protein  65.4 
 
 		 250 aa  340  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0318  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  63.82 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3043  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  61.79 
 
 		 252 aa  338  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4242  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  65.69 
 
 		 249 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3758  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.45 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0165  Sec-independent periplasmic protein translocation protein TatC  67.34 
 
 		 255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03731  TatABCE protein translocation system subunit  59.36 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4141  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.36 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4221  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.36 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5279  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.36 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.613586  normal  0.20665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4310  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.36 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4062  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.36 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4170  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.36 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164858 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03680  hypothetical protein  59.36 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4359  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.36 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4051  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.82 
 
 		 250 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0253  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  65.09 
 
 		 256 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.3231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3910  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  63.67 
 
 		 255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001922  twin-arginine translocation protein TatC  65.97 
 
 		 250 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3940  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.92 
 
 		 258 aa  318  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0276  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.92 
 
 		 258 aa  318  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3636  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  59.92 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3955  twin-arginine protein translocation system subunit TatC  62.5 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0447  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  60.4 
 
 		 263 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5018  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.84 
 
 		 262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4892  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.84 
 
 		 262 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0547  Sec-independent protein translocase TatC  62.7 
 
 		 245 aa  312  3.9999999999999997e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0576043  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5809  twin arginine-targeting protein translocase TatC  58.2 
 
 		 267 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66980  sec-independent protein translocase TatC  58.2 
 
 		 267 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0332914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5157  sec-independent protein translocase TatC  57.37 
 
 		 266 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0382  Sec-independent periplasmic protein translocase  56.57 
 
 		 266 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5068  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58.23 
 
 		 262 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3060  Sec-independent periplasmic protein translocase, TatC  59.92 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3422  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  59.84 
 
 		 260 aa  301  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0591  Sec-independent protein translocase TatC  58.26 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0294622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3226  hypothetical protein  59 
 
 		 257 aa  298  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.849662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0380  Sec-independent periplasmic protein translocase  56.22 
 
 		 264 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0516  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  57.81 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1974  Sec-independent protein translocase TatC  60.79 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.812349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0132  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  56.97 
 
 		 398 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1486  Sec-independent protein translocase TatC  57.27 
 
 		 254 aa  288  7e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.450631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0221  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  58 
 
 		 368 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45480  twin arginine-targeting protein translocase  53.36 
 
 		 265 aa  284  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2610  Sec-independent protein translocase TatC  57.14 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1702  Sec-independent protein translocase TatC  52.69 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0741  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  55.23 
 
 		 258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0260  Sec-independent protein translocase TatC  55.13 
 
 		 244 aa  271  9e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0872197  hitchhiker  0.00458614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1039  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.94 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1080  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.94 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.557784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0808  Sec-independent protein translocase TatC  49.81 
 
 		 266 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4187  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.7 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1036  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51.87 
 
 		 253 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1087  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.81 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2746  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.19 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0915  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  45.53 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3235  Sec-independent protein translocase TatC  52.74 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2002  Sec-independent protein translocase TatC  52.4 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.4915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0365  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0356  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  51 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0117  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  48.22 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.433912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0411  Sec-independent protein translocase TatC  52.65 
 
 		 259 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.856028  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3547  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.65 
 
 		 259 aa  241  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146328  hitchhiker  0.0021948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3536  Sec-independent protein translocase TatC  53.51 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2305  Sec-independent protein translocase TatC  51.09 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.920568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0341  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  53.07 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0370444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3217  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  50.6 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.920211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2940  putative SEC-independent translocase protein TATC transmembrane  53.04 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2870  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.19 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0371703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0118  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  49.39 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2669  Sec-independent protein translocase TatC  52.63 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0438  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.63 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.434493  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0417  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  52.63 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3098  Sec-independent protein translocase TatC  53.65 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.923548  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0699  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  46.4 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0783  Sec-independent protein translocase TatC  45.28 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.037642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>