More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0322 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.47 
 
 
657 aa  853    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  67.07 
 
 
662 aa  957    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  66.92 
 
 
662 aa  944    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.02 
 
 
654 aa  851    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  100 
 
 
653 aa  1358    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  66.47 
 
 
662 aa  954    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  61.66 
 
 
654 aa  853    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.07 
 
 
662 aa  959    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.67 
 
 
661 aa  938    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  68.13 
 
 
662 aa  950    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  60.64 
 
 
654 aa  855    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.54 
 
 
659 aa  942    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  51.75 
 
 
649 aa  675    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.67 
 
 
661 aa  946    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  61.31 
 
 
649 aa  850    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  67.07 
 
 
662 aa  959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  50.53 
 
 
653 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  39.45 
 
 
642 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.9 
 
 
623 aa  476  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  36.75 
 
 
648 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.74 
 
 
650 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.62 
 
 
646 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  30.17 
 
 
640 aa  310  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  30.09 
 
 
655 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.54 
 
 
656 aa  281  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.49 
 
 
665 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.5 
 
 
665 aa  262  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.37 
 
 
705 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.27 
 
 
655 aa  253  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.84 
 
 
632 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.68 
 
 
645 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.14 
 
 
666 aa  246  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.54 
 
 
645 aa  246  9e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.39 
 
 
645 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  31.58 
 
 
646 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.21 
 
 
644 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  27.6 
 
 
645 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.2 
 
 
632 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.25 
 
 
645 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.53 
 
 
645 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.52 
 
 
644 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  37.23 
 
 
759 aa  231  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.11 
 
 
652 aa  230  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.05 
 
 
656 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.02 
 
 
907 aa  227  6e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.56 
 
 
634 aa  226  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.51 
 
 
688 aa  226  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.01 
 
 
924 aa  226  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.66 
 
 
665 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.53 
 
 
630 aa  223  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.96 
 
 
682 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.13 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28 
 
 
755 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.87 
 
 
706 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.81 
 
 
631 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  26.96 
 
 
636 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  26.9 
 
 
634 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.8 
 
 
629 aa  207  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.42 
 
 
662 aa  203  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.61 
 
 
642 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.77 
 
 
626 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  26.37 
 
 
694 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.3 
 
 
626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.87 
 
 
688 aa  198  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.18 
 
 
642 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.07 
 
 
641 aa  196  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.81 
 
 
636 aa  196  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30 
 
 
685 aa  191  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.63 
 
 
632 aa  190  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.61 
 
 
686 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.76 
 
 
731 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.29 
 
 
686 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.16 
 
 
626 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  35.37 
 
 
665 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.12 
 
 
626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.12 
 
 
626 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  32.73 
 
 
653 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.13 
 
 
650 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  29.77 
 
 
681 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.25 
 
 
692 aa  165  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.13 
 
 
629 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  27.99 
 
 
649 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  30.87 
 
 
867 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.88 
 
 
615 aa  134  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.27 
 
 
594 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  25.1 
 
 
678 aa  134  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.72 
 
 
655 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.24 
 
 
677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1383  prolyl oligopeptidase family protein  31.2 
 
 
686 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
683 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.07 
 
 
682 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.3 
 
 
607 aa  128  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.07 
 
 
682 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.66 
 
 
674 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.49 
 
 
617 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.07 
 
 
682 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.13 
 
 
596 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.07 
 
 
682 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.66 
 
 
674 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2294  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.36 
 
 
776 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237204  normal  0.953855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>