More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0151 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
420 aa  860    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.87 
 
 
415 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.18 
 
 
415 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.42 
 
 
415 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.42 
 
 
415 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.42 
 
 
415 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  73.73 
 
 
415 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  73.49 
 
 
415 aa  628  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  73.49 
 
 
415 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.49 
 
 
415 aa  625  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.46 
 
 
415 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.13 
 
 
413 aa  607  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.75 
 
 
416 aa  471  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.18 
 
 
418 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.31 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.31 
 
 
423 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.64 
 
 
418 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.34 
 
 
418 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 
418 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
418 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
434 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.33 
 
 
456 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
418 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.16 
 
 
418 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
418 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 
414 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.57 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.94 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.81 
 
 
425 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.38 
 
 
418 aa  398  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.73 
 
 
418 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 
418 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 
418 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 
418 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.28 
 
 
423 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.44 
 
 
418 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 
415 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.23 
 
 
410 aa  385  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.38 
 
 
415 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.95 
 
 
427 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.4 
 
 
448 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.74 
 
 
414 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
419 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
423 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.91 
 
 
415 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.14 
 
 
419 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.06 
 
 
420 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.61 
 
 
416 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.68 
 
 
432 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.74 
 
 
419 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.78 
 
 
417 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.91 
 
 
415 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 
418 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.99 
 
 
418 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.55 
 
 
421 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 
418 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
428 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.65 
 
 
425 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.24 
 
 
430 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.35 
 
 
423 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.11 
 
 
423 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.87 
 
 
421 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.06 
 
 
423 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.99 
 
 
418 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.62 
 
 
419 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.99 
 
 
417 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 
421 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.03 
 
 
415 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.82 
 
 
446 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.1 
 
 
422 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 
407 aa  365  1e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.63 
 
 
425 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.56 
 
 
426 aa  364  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.78 
 
 
419 aa  364  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.02 
 
 
431 aa  363  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.34 
 
 
417 aa  364  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.35 
 
 
423 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.48 
 
 
435 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
446 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
421 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.45 
 
 
425 aa  363  4e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7264  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.04 
 
 
419 aa  363  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.79 
 
 
424 aa  362  7.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.99 
 
 
419 aa  361  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.44 
 
 
434 aa  361  1e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1818  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.1 
 
 
429 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.47 
 
 
424 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.99 
 
 
424 aa  359  4e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.16 
 
 
421 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.1 
 
 
427 aa  359  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0612  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.43 
 
 
436 aa  359  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642668 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.67 
 
 
424 aa  359  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.05 
 
 
417 aa  359  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.1 
 
 
418 aa  359  6e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.4 
 
 
420 aa  358  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.62 
 
 
424 aa  358  9e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 
418 aa  358  9e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 
419 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.35 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>