244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0118 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  77.17 
 
 		 286 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  74.83 
 
 		 286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  74.83 
 
 		 286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0149  Hsp33-like chaperonin  74.83 
 
 		 286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0146  Hsp33-like chaperonin  74.83 
 
 		 286 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  72.08 
 
 		 286 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  69.93 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  69.93 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  69.93 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  71.33 
 
 		 286 aa  424  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  69.93 
 
 		 286 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  68.55 
 
 		 290 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  69.23 
 
 		 286 aa  401  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  69.93 
 
 		 286 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0166  Hsp33-like chaperonin  65.11 
 
 		 294 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.210255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3977  Hsp33-like chaperonin  57.99 
 
 		 293 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3738  Hsp33-like chaperonin  57.99 
 
 		 293 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  58.06 
 
 		 292 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  58.57 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 		 292 aa  342  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  58.93 
 
 		 292 aa  342  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  58.93 
 
 		 292 aa  342  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  58.93 
 
 		 292 aa  342  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0175  Hsp33-like chaperonin  57.64 
 
 		 293 aa  341  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  58.21 
 
 		 294 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  58.21 
 
 		 294 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  58.99 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  56.64 
 
 		 289 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  56.45 
 
 		 292 aa  335  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  54.33 
 
 		 291 aa  334  7.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  58.48 
 
 		 290 aa  333  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4072  Hsp33-like chaperonin  54.93 
 
 		 289 aa  330  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  53.98 
 
 		 296 aa  327  9e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  51.9 
 
 		 291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  55.05 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  50.17 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03953  Hsp33-like chaperonin  49.49 
 
 		 299 aa  299  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  48.76 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  48.57 
 
 		 286 aa  278  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1648  Hsp33-like chaperonin  46.57 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00511557  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2074  Hsp33 protein  44.25 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3753  Hsp33 protein  44.4 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  42.81 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  43.84 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0518  Hsp33 protein  44.06 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  43.49 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  42.61 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  41.1 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  41.44 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  40.41 
 
 		 299 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  40.41 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  40.35 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  40.41 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0165  Hsp33 protein  44.01 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  43.88 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  41.44 
 
 		 300 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1001  Hsp33 protein  42.46 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  41.1 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3626  heat shock protein HSP33  39.45 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.72943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3996  Hsp33 protein  41.13 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  38.26 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  38.26 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  38.26 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  38.26 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  38.26 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  38.26 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  38.26 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0334  Hsp33 protein  41.22 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.107665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1108  Hsp33 protein  42.45 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1179  Hsp33 protein  39.29 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.863394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1170  Hsp33 protein  36.91 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000410448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5410  Hsp33 protein  36.24 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3187  Hsp33 protein  38.49 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1897  33 kDa. chaperonin  37.25 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2141  Hsp33 protein  36.24 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0333  Hsp33 protein  38.69 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2122  Hsp33 protein  36.24 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2014  Hsp33 protein  36.24 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.904084  hitchhiker  0.00347972 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2104  Hsp33 protein  36.24 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3451  Hsp33 protein  37.46 
 
 		 335 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2870  hypothetical protein  36.23 
 
 		 281 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0302  heat shock protein, Hsp33  37.91 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  35.87 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1576  putative Hsp33 chaperonin  38.05 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37783  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1163  Hsp33 protein  39.6 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1071  Hsp33 protein  38.94 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2557  Hsp33 protein  37.87 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179906  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1243  Hsp33 protein  36.6 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5973  Hsp33 protein  36.3 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0975  Hsp33 protein  38.94 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0472426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1436  Hsp33 protein  37.04 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0994  Hsp33 protein  37.7 
 
 		 335 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>