168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0094 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0130  protease, putative  56.9 
 
 
935 aa  950    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  54.07 
 
 
865 aa  912    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 
865 aa  1777    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  56.29 
 
 
936 aa  952    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  56.53 
 
 
936 aa  954    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  57.21 
 
 
945 aa  983    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  55.43 
 
 
856 aa  920    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  56.01 
 
 
965 aa  922    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  56.65 
 
 
938 aa  921    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  53.51 
 
 
871 aa  885    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  56.26 
 
 
951 aa  926    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  56.49 
 
 
869 aa  939    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  53.94 
 
 
867 aa  909    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  56.94 
 
 
951 aa  942    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  54.53 
 
 
938 aa  874    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  53.7 
 
 
871 aa  884    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  38.64 
 
 
918 aa  544  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  34.32 
 
 
751 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  32.32 
 
 
795 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  31.35 
 
 
796 aa  328  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  34.83 
 
 
794 aa  327  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.09 
 
 
795 aa  327  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  34.53 
 
 
795 aa  325  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  34.68 
 
 
794 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  34.53 
 
 
795 aa  325  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  34.23 
 
 
812 aa  324  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  30.59 
 
 
799 aa  324  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  34.13 
 
 
796 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  30.59 
 
 
799 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  30.51 
 
 
799 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.1 
 
 
796 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  30.7 
 
 
796 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  33.28 
 
 
799 aa  321  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.06 
 
 
795 aa  320  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  31.51 
 
 
795 aa  319  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  30.82 
 
 
795 aa  319  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  30.93 
 
 
795 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  30.82 
 
 
795 aa  319  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  30.93 
 
 
795 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  33.28 
 
 
799 aa  317  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  33.28 
 
 
799 aa  317  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  33.28 
 
 
799 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  33.13 
 
 
799 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  33.13 
 
 
799 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  33.17 
 
 
795 aa  313  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  30.5 
 
 
770 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.83 
 
 
927 aa  219  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  30.92 
 
 
763 aa  214  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  30.34 
 
 
763 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  29.88 
 
 
764 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.09 
 
 
744 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  27.9 
 
 
771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  28.83 
 
 
781 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  29.94 
 
 
746 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  28.68 
 
 
760 aa  180  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  27.04 
 
 
924 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  28.15 
 
 
1045 aa  172  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  28.57 
 
 
806 aa  168  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  26.86 
 
 
768 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.38 
 
 
747 aa  158  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  26.38 
 
 
811 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  26.92 
 
 
825 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  32.27 
 
 
566 aa  83.2  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  25.87 
 
 
480 aa  73.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  27.09 
 
 
513 aa  71.2  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  25.77 
 
 
1024 aa  67  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  46.48 
 
 
918 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  28.04 
 
 
666 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  29.71 
 
 
633 aa  62.4  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.91 
 
 
1158 aa  61.2  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  30.81 
 
 
735 aa  58.9  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  39.18 
 
 
713 aa  58.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  39.67 
 
 
1096 aa  58.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  32.39 
 
 
1309 aa  57.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  39.67 
 
 
1028 aa  57.8  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  32.8 
 
 
1150 aa  57.4  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  50 
 
 
1300 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  40.21 
 
 
1916 aa  56.6  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  33.79 
 
 
952 aa  53.5  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  35.16 
 
 
2272 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  41 
 
 
1667 aa  52.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  26.37 
 
 
666 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.95 
 
 
3295 aa  52  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  40.66 
 
 
1135 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.45 
 
 
1200 aa  51.6  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  38 
 
 
998 aa  51.6  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  40.74 
 
 
818 aa  50.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  38.71 
 
 
948 aa  50.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  34.92 
 
 
1969 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.47 
 
 
699 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  41.56 
 
 
1151 aa  50.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  34.92 
 
 
3197 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.75 
 
 
2554 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  30.36 
 
 
994 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  37.68 
 
 
1814 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  37.9 
 
 
1565 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.85 
 
 
945 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.87 
 
 
835 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.72 
 
 
1732 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  39.74 
 
 
1027 aa  50.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>