More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0092 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 
197 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  94.39 
 
 
218 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  92.86 
 
 
197 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  92.86 
 
 
197 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  92.86 
 
 
197 aa  359  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  92.35 
 
 
197 aa  358  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  91.84 
 
 
197 aa  358  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  90.86 
 
 
197 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  91.37 
 
 
197 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  90.86 
 
 
199 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  90.82 
 
 
197 aa  351  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  89.8 
 
 
198 aa  348  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  87.63 
 
 
198 aa  346  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  88.6 
 
 
200 aa  345  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  87.63 
 
 
201 aa  344  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  87.31 
 
 
197 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  71.35 
 
 
196 aa  286  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.82 
 
 
200 aa  273  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  63.73 
 
 
194 aa  258  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.89 
 
 
197 aa  247  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.4 
 
 
197 aa  246  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002135  multiple antibiotic resistance protein marC  65.8 
 
 
194 aa  245  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.37 
 
 
197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  62.37 
 
 
197 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  62.37 
 
 
197 aa  240  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  62.37 
 
 
197 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.37 
 
 
197 aa  240  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.37 
 
 
197 aa  240  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.37 
 
 
197 aa  240  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.37 
 
 
197 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.37 
 
 
197 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  61.86 
 
 
197 aa  239  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.89 
 
 
197 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.37 
 
 
197 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.21 
 
 
197 aa  231  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.21 
 
 
197 aa  231  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.89 
 
 
197 aa  231  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.21 
 
 
194 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.06 
 
 
196 aa  201  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2133  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.08 
 
 
198 aa  195  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.382679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2224  hypothetical protein  53.57 
 
 
198 aa  192  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2864  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.61 
 
 
212 aa  192  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01317  multiple antibiotic resistance protein MarC  53.09 
 
 
199 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.355681  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.81 
 
 
197 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  47.12 
 
 
199 aa  174  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  47.89 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.81 
 
 
197 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.6 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.62 
 
 
200 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.1 
 
 
203 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.15 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.15 
 
 
201 aa  165  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2516  MarC membrane protein  45.13 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.376397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3517  hypothetical protein  45.13 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.836337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3481  MarC membrane protein  45.13 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1147  hypothetical protein  44.62 
 
 
200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.938365  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0438  MarC membrane protein  45.13 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3266  MarC membrane protein  45.13 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1297  MarC membrane protein  45.13 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3519  MarC membrane protein  45.13 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0558  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.31 
 
 
200 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0491  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.79 
 
 
200 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51349  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0588  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.31 
 
 
200 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2198  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.22 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.617868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0516  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.31 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0622801  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3673  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.79 
 
 
200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543765  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0106  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.79 
 
 
200 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  42.78 
 
 
197 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  42.78 
 
 
197 aa  156  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.41 
 
 
196 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  39.68 
 
 
200 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6285  hypothetical protein  45.92 
 
 
197 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0447  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.92 
 
 
200 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1018  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.9 
 
 
201 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.93 
 
 
197 aa  149  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2070  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.71 
 
 
203 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72410  hypothetical protein  45.92 
 
 
197 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0182  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.9 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000388483  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.13 
 
 
222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.302535  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.84 
 
 
205 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1167  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.11 
 
 
200 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.85 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.87 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.54 
 
 
207 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  31.98 
 
 
210 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  33.5 
 
 
206 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.5 
 
 
206 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.99 
 
 
207 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.86 
 
 
212 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  28.71 
 
 
204 aa  97.8  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1724  MarC family integral membrane protein  32.65 
 
 
194 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0241  hypothetical protein  27.46 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.425309  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.63 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.67 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.08 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.59 
 
 
219 aa  91.3  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.18 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.68 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174302  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.59 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.72 
 
 
198 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>