100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0090 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  535  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  62.3 
 
 		 260 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  60.47 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  60.4 
 
 		 253 aa  332  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  60.4 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  59.92 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  59.92 
 
 		 266 aa  329  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  60.32 
 
 		 266 aa  328  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  59.92 
 
 		 266 aa  328  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  60.32 
 
 		 266 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  59.52 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  59.13 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  58.73 
 
 		 267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  60.64 
 
 		 249 aa  318  5e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  57.2 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  57.43 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  45.82 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  42.92 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  42 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  42.02 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  41.43 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  42.23 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  41 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  35.38 
 
 		 260 aa  184  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  40.42 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  38.89 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  37.55 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  38.67 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  40.16 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  37.7 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  38.08 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  39.11 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  39.76 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  40.16 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  39.42 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  36.86 
 
 		 275 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  39.27 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  37.3 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  37.3 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  36.48 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  39.02 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  37.15 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  37.78 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  39.26 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  37.23 
 
 		 281 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  37.23 
 
 		 281 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  37.23 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  37.35 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  37.23 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  39.68 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  39.26 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  39.26 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  39.26 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  39.26 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  39.26 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  34.85 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  39.26 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  40.68 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  37.07 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  37.07 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  34.92 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  34.47 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  35 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  34.73 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  32.81 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  32.95 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  38.13 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  36.99 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  36.86 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  35.18 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  36.55 
 
 		 295 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  34.48 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  33.73 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  32.03 
 
 		 274 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  31.02 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  32.17 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  30.68 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  36.3 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  35.33 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  30.13 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  36.09 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  31.12 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  30.86 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  31.17 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  36.22 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  30.74 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  30.74 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  31.25 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0880  protein of unknown function DUF833  30.06 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  36.59 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  33.57 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  29.54 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  28.79 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  28.8 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  31.1 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  29.7 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  40.54 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  25.41 
 
 		 406 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  27.97 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>